MHC区域单核苷酸多态性rs9468925与汉族人寻常型白癜风表型的相关性研究

MHC区域单核苷酸多态性rs9468925与汉族人寻常型白癜风表型的相关性研究

论文摘要

背景白癜风(OMIM,#193200)属于一种多基因遗传病,因不同种族不同地域而呈现不同的患病率[2-4]。白癜风是一种常见的色素减退性皮肤病,主要侵犯皮肤及毛发的发病机制不明的复杂性疾病。其发病机制迄今尚未完全阐明,目前认为机制包括遗传学说、自身免疫学说、黑素细胞自身破坏学说、神经化学因子学说等,但均未定论。其中遗传因素在白癜风的发病中具有重要作用。以往主要通过连锁分析和候选基因方法研究白癜风的易感基因。现在我们通过全基因组关联分析研究发现在MHC区域上发现两个独立的关联信号即突变位点(rs11966200, rs9468925 ),进一步研究发现rs1196200可能与HLA-A*3001, HLA-B*1302, HLA-C*0602以及HLA-DRB1*0701的等位基因相关联,而rs9468925可能代表了一个以前所未知的易感基因。同时还发现了一个以前未被描述的风险位点位于6q27(rs2236313),此处包含了三个基因RNASET2, FGFR1OP和CCR6。为探讨该SNP位点是否与汉族人白癜风表型相关,本研究应用课题组白癜风易感基因的GWA研究结果,分析MHC区域上的一个SNPrs9468925的单核苷酸多态性与汉族人寻常型白癜风表型的关系。目的对寻常型白癜风发病年龄、发病面积、家族史、伴发自身免疫疾病及临床类型进行分层分析,在汉族人群中研究寻常型白癜风MHC区域一个SNPrs9468925单核苷酸多态性与白癜风表型的相关性,为进一步探讨白癜风的发病机制提供重要的遗传学依据。方法5,566例白癜风患者和6,462例正常对照的MHC区域单核苷酸多态性rs9468925位点基因分型(AA、AG、GG)资料均来源于本课题组白癜风全基因组关联分析的Illumina 610芯片分型数据,数据资料经适当转化后应用社会科学统计软件包SPSS10.0对资料进行统计学分析。结果1.病例组与对照组的基因型总体分布差异具有统计学意义(χ2=138.4,df=2,P=8.85×10-31),病例组与对照组的等位基因分布差异亦具有统计学意义(χ2=136.49,df=1,P=1.56×10-31,OR= 0.73,95%CI:0.69-0.77)。2.发病患者年龄≤20岁与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异均有统计学意义(χ2=140.93,df=2,P=2.50×10-31;χ2=140.42,df=1,P=2.16×10-32,OR= 0.68,95%CI:0.63-0.72)。发病患者年龄>20岁与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异亦具有统计学意义(χ2=43.87,df=2,P=2.97×10-10;χ2=43.23,df=1,P=4.87×10-11,OR 0.80,95%CI 0.74-0.85)。发病患者≤20岁和发病患者>20岁之间rs9468925位点基因型和等位基因分布差异均有统计学意义(χ2=16.53,df=2,P=2.57×10-4;χ2=16.1,df=1,P=6.01×10-5,OR= 0.80,95%CI:0.74-0.85)。3.涉及皮损面积<5%的患者与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异均有统计学意义(χ2=109.4,df=2,P=1.72×10-24;χ2=109.67,df=1,P=1.16×10-25,OR= 0.73,95%CI:0.69-0.77)。涉及皮损面积≥5%的患者与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异均有统计学意义(χ2=63.79,df=2,P=1.41×10-14;χ2=58.71,df=1,P=1.83×10-14,OR= 0.72,95%CI:0.66-0.78)。涉及皮损面积<5%的患者和涉及皮损面积≥5%的患者之间rs9468925位点基因型有统计学意义(χ2=7.39,df=2,P=0.025),等位基因分布差异无统计学意义(χ2=0.3,df=1,P=0.58,OR= 1.03,95%CI:0.94-1.12)。4.家族史阳性患者与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异均有统计学意义(χ2=34.97,df=2,P=2.55×10-8;χ2=32.92,df=1,P=9.59×10-9,OR= 0.70,95%CI:0.63-0.79)。家族史阴性患者与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异亦具有统计学意义(χ2=63.79,df=2,P=1.41×10-14;χ2=58.71,df=1,P=1.83×10-14,OR= 0.72,95%CI:0.66-0.78)。家族史阳性患者和阴性患者间rs9468925位点基因型和等位基因分布差异均无统计学意义(χ2=3.28,df=2,P=0.19;χ2=0.38,df=1,P=0.54,OR =0.96,95%CI:0.85-1.09)。5.伴发自身免疫疾病的患者与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异均有统计学意义(χ2=14.23,df=2,P=0.001;χ2=13.94,df=1,P=1.88×10-4,OR= 0.72,95%CI:0.60-0.85)。不伴发自身免疫疾病的患者与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异亦具有统计学意义(χ2=132.93,df=2,P=1.36×10-29;χ2=131.18,df=1,P=1.93×10-30,OR= 0.73,95%CI:0.69-0.77)。伴发自身免疫疾病的患者和不伴发自身免疫疾病的患者之间rs9468925位点基因型和等位基因分布差异均无统计学意义(χ2=0.43,df=2,P=0.81;χ2=0.57,df=1,P=0.45,OR= 1.09,95%CI:0.87-1.37)。6.局限型患者与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异均有统计学意义(χ2=38.04,df=2,P=5.48×10-9;χ2=37.06,df=1,P=1.14×10-9,OR= 0.79,95%CI:0.73-0.85)。散发型患者与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异亦具有统计学意义(χ2=121.83,df=2,P=3.51×10-27;χ2=119.87,df=1,P=6.76×10-28,OR= 0.70,95%CI:0.66-0.75)。泛发型患者与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异亦具有统计学意义(χ2=14.41,df=2,P=0.001;χ2=13.31,df=1,P=2.64×10-4,OR= 0.79,95%CI:0.73-0.85)。面肢型患者与对照比较,rs9468925位点基因型和等位基因分布差异亦具有统计学意义(χ2=17.00,df=2,P=2.04×10-4;χ2=16.05,df=1,P=6.17×10-5,OR= 0.72,95%CI:0.62-0.85)。各临床类型患者rs9468925位点基因型分布差异有统计学意义(χ2=13.98,df=6,P=0.03),等位基因分布差异无统计学意义(χ2=6.74,df=3,P=0.08)。结论1.MHC区域rs9468925遗传多态性与汉族人寻常型白癜风的易感性相关。2.汉族人白癜风患者MHC区域rs9468925遗传多态性与发病年龄有显著相关性。3.汉族人白癜风患者MHC区域rs9468925遗传多态性与发病面积有显著相关。4.MHC区域rs9468925遗传多态性与汉族人白癜风的临床发病类型有显著相关性。MHC区域rs9468925遗传多态性均对白癜风的有无家族史,是否伴发自身免疫性疾病的影响作用较弱,可能与白癜风具有不同的遗传学基础和不同的发病机制有关。

论文目录

  • 英文缩略词表
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 调查表的设计
  • 2.2 临床资料收集及录入过程中质量控制方法
  • 2.3 研究对象
  • 2.4 MHC 区域rs9468925 位点基因分型
  • 2.5 临床表型的评定
  • 2.6 统计学方法
  • 3 结果
  • 3.1 遗传平衡吻合度检验
  • 3.2 病例组与对照组间 MHC 区域单核苷酸多态性rs9468925 位点基因型和等位基因频率比较
  • 3.3 MHC 基因多态性rs9468925 位点和临床表型比较
  • 3.3.1 发病年龄
  • 3.3.2 发病面积
  • 3.3.3 家族史
  • 3.3.4 伴发自身免疫性疾病
  • 3.3.5 临床类型
  • 4. 讨论
  • 4.1 病例和对照间MHC区域单核苷酸多态性rs9468925位点分析
  • 4.2 MHC 区域单核苷酸多态性rs9468925 与临床表型分析
  • 4.2.1 与发病年龄比较
  • 4.2.2 与发病面积比较
  • 4.2.3 与有无家族史比较
  • 4.2.4 与是否伴发自身免疫性疾病比较
  • 4.2.5 与临床类型比较
  • 5. 结论
  • 参考文献
  • 附录
  • 致谢
  • 课题综述
  • 参考文献
  • 相关论文文献

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