分子电泳检测方法及其装置的研究

分子电泳检测方法及其装置的研究

论文摘要

在分子生物学、医学与临床诊断以及基因组检测工程等研究领域,如何正确地、迅速有效地完成分子基因的检测,成为了分子生物学、光电子技术和科学仪器等交叉学科的重要课题。凝胶分子电泳技术将DNA和RNA等遗传分子按照其分子量的大小进行分离检测,是分子基因检测过程中不可缺少的重要环节。长期以来该技术被广泛应用于PCR产物分离、基因组测序、多态性分析与突变检测、限制性片段分析等。在人类基因组测序中,分离大片段DNA,有利于提高大规模测序效率。但是,无论是传统平板凝胶电泳技术,还是效率更高的直流毛细管分子电泳分离技术,至今都难以实现对大片段的DNA或RNA正确、迅速、有效地进行分离检测。为此,本研究(论文)创造性的利用光学、脉冲电场、凝胶分子电泳技术相融合,为解决大片段的DNA或RNA分离检测、提高检测系统的正确性和有效性,开展了大量的理论和技术调查、实验摸索、国际合作研究等。在此基础上,提出了利用直流、脉冲电场研究分子电泳过程和基因分离检测,并利用该技术总结出适合不同条件的―脉冲电场分子电泳技术与检测方法‖,解决了长期以来难以正确、迅速对大片段DNA和RNA分离检测的课题。围绕着直流、脉冲电场下分子电泳过程和分离检测,本研究首先对直流毛细管电泳下的小片段DNA(0.1-1.0kbp)在凝胶内的迁移机制进行了研究,从理论和实验两方面分析了直流电场下,分离电场、凝胶浓度、毛细管有效长度、样品进样等相关因素对DNA分离效率的影响。为实现小片段DNA的快速有效分离,论文创造性的提出了―可变电压毛细管电泳快速分离技术与方法‖。该方法实现了分子电泳高速分离检测小片段DNA分子。在论证可变电压毛细管电泳快速分离技术与方法的基础上,为了更有效地实现大片段DNA的快速有效分离,通过实验研究了方波脉冲毛细管电泳分离检测大片段DNA(0.1-10.0kbp)分子,分析了方波脉冲毛细管电泳的工作过程、特性以及与DNA分离机制相关的因素,结果发现方波脉冲毛细管电泳在改善大片段DNA分离效率的同时会降低小片段DNA的分辨效率。在此基础上论文首次创造性的提出了―反向脉冲分子毛细管电泳技术‖,论文通过大量实验,利用反向脉冲毛细管分子电泳成功分离出限制性内切酶EcoT14 I作用片段λ-DNA,并论证了该技术与方法可以同时实现各大小片段DNA分子的正确高效的电泳分离检测。在脉冲毛细管电泳分析DNA的基础上,首次完成了脉冲毛细管电泳分离大片段RNA(0.1-10.0knt)的工作,探讨了脉冲电场下不同凝胶浓度、调制深度及脉冲频率时DNA和RNA在电泳中迁移机理的异同性。在此基础上,首次提出了在线脉冲毛细管电泳分离RNA新技术,该技术可以实现大片段RNA在毛细管内变性与分离同时有效进行。论文同时研究了在线脉冲毛细管电泳时各个因素对RNA分离机制的影响,并且分析了脉冲环境下变性剂对RNA在凝胶中迁移机制的影响。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 绪论
  • 1.1 毛细管电泳简介
  • 1.2 毛细管电泳的基本原理
  • 1.3 毛细管电泳的分离模式
  • 1.4 毛细管电泳分离效率评价
  • 1.5 毛细管电泳进样方式
  • 1.6 本研究采用的装置与试剂
  • 1.6.1 本研究采用的毛细管电泳装置
  • 1.6.2 本研究采用的凝胶
  • 1.6.3 毛细管内壁镀膜方法
  • 1.7 本论文的主要内容与创新点
  • 1.7.1 本文的内容安排
  • 1.7.2 本文的主要创新点
  • 参考文献
  • 第二章 直流毛细管电泳DNA 分离的研究
  • 2.1 概述
  • 2.2 仪器与试剂
  • 2.3 结果与分析
  • 2.3.1 电场强度对毛细管电泳DNA 分离特性的影响
  • 2.3.2 凝胶浓度对毛细管电泳DNA 分离特性的影响
  • 2.3.3 毛细管有效长度对DNA 分离特性的影响
  • 2.3.4 样品进样对毛细管电泳区带加宽的影响
  • 2.3.5 可变分离电压毛细管电泳分离DNA 片段的模拟
  • 2.4 本章小结
  • 参考文献
  • 第三章 方波脉冲毛细管电泳DNA 分离的研究
  • 3.1 概述
  • 3.2 材料与方法
  • 3.2.1 仪器与试剂
  • 3.2.2 方波脉冲毛细管电泳电泳条件
  • 3.3 结果与分析
  • 3.3.1 凝胶浓度对方波脉冲毛细管电泳DNA 分离效率的影响
  • 3.3.2 平均电场强度对方波脉冲毛细管电泳DNA 分离效率的影响
  • 3.3.3 调制深度对方波脉冲毛细管电泳DNA 分离效率的影响
  • 3.3.4 脉冲频率对方波脉冲毛细管电泳DNA 分离效率的影响
  • 3.4 本章小结
  • 参考文献
  • 第四章 反向脉冲毛细管电泳技术分离DNA
  • 4.1 概述
  • 4.2 材料与方法
  • 4.2.1 仪器与试剂
  • 4.2.2 限制性内切酶与λ-DNA 作用过程
  • 4.2.3 反向脉冲毛细管电泳电泳条件
  • 4.3 结果与分析
  • 4.3.1 直流与反向脉冲毛细管电泳分析DNA
  • 4.3.2 凝胶浓度对反向脉冲毛细管电泳DNA 分离效率的影响
  • 4.3.3 调制深度对反向脉冲毛细管电泳DNA 分离效率的影响
  • 4.3.4 脉冲电压对反向脉冲毛细管电泳分离DNA 分离效率的影响
  • 4.3.5 反向脉冲毛细管电泳DNA 分离机制分析
  • 4.3.6 反向脉冲电泳分离限制性内切酶酶切λ-DNA 片段
  • 4.4 本章小结
  • 参考文献
  • 第五章 脉冲毛细管电泳RNA 分离的研究
  • 5.1 概述
  • 5.2 材料与方法
  • 5.2.1 仪器与试剂
  • 5.2.2 尿素变性RNA
  • 5.2.3 脉冲毛细管电泳电泳条件
  • 5.3 结果与分析
  • 5.3.1 直流与脉冲毛细管电泳分离RNA
  • 5.3.2 凝胶浓度对脉冲毛细管电泳分离 RNA 的影响
  • 5.3.3 调制深度对脉冲毛细管电泳分离 RNA 的影响
  • 5.3.4 脉冲频率对脉冲毛细管电泳分离 RNA 的影响
  • 5.3.5 脉冲毛细管电泳时 RNA 与 DNA 运动机制分析
  • 5.4 本章小结
  • 参考文献
  • 第六章 在线脉冲毛细管电泳RNA 分离的研究
  • 6.1 概述
  • 6.2 材料与方法
  • 6.3 结果与分析
  • 6.4 本章小结
  • 参考文献
  • 第七章 总结与工作展望
  • 7.1 本文主要工作与创新点
  • 7.2 今后工作的展望
  • 致谢
  • 攻读博士学位期间已发表或待发表的论文
  • 相关论文文献

    标签:;  ;  ;  

    分子电泳检测方法及其装置的研究
    下载Doc文档

    猜你喜欢