基于SSR,AFLP及ITS标记在梨和胡柚系统演化上的研究

基于SSR,AFLP及ITS标记在梨和胡柚系统演化上的研究

论文摘要

本论文采用SSR、AFLP及ITS标记技术,开展了梨属和胡柚的系统演化关系研究,主要结果如下: (1)利用SSR标记技术对98个东方梨栽培种和品种的演化关系进行了分析。6对SSR引物(BGA35、KU10、BGT23b、NH004a、NH011b和NH015a)共产生168个等位位点,平均每对引物产生28个等位位点且平均杂和度为0.631。不同品种间的相似系数从0.02到0.98,西方梨与东方梨之间的相似系数较低。聚类分析结果显示,梨属内98个种或品种(主要为东亚原产)可分成10个组。中国砂梨、中国白梨和日本梨集中于其中的4个组,中国砂梨分散于这4个组中,呈现丰富的遗传多样性,中国白梨占3个组,而日本梨分布在1个组中。中国白梨和中国砂梨交错聚合在一起,部分日本梨品种与中国砂梨有较高的相似系数。秋子梨品种与日本青梨聚在了一起,显示了一定的亲缘关系。西方梨形成了3个独立的组并远离东方梨(除杜梨外)。 (2)利用AFLP标记技术对100个东方梨栽培种和品种的演化关系进行了分析。在此,我们增加了日本高知县山区采集的梨类型,日本古老品种和中国白梨砂梨重叠分布区域的梨类型。6对不同选择性引物组合(EcoRI-AAG/MseI-CAT,EcoRI-ACI/MseI-CTT,EcoRI-AAC/MseI-CAG,EcoRI-AAC/MseI-CTA,EcoRI-AAC/MseI-CAA和EcoRI-AAG/MseI-CTC)成功地区分了供试样品,获得649条扩增谱带,其中多态性条带580条,6对引物的平均多态率为89%,其中以引物EcoRI-AAG/MseI-CTC的多态性最高(94%),引物EcoRI-AAG/MseI-CAT的最低(83%)。6对引物的He值介于0.1837-0.2266之间,在中国砂梨、中国白梨和日本梨3个群中以中国砂梨的期望杂和度最高,遗传多样性最丰富;聚类分析结果表明,供试样品被分成了15个组,中国砂梨分散分布于7个组,且与中国白梨相互交错在一起,显示中国白梨和中国砂梨较近的亲缘关系。部分日本梨形成了较为独立的一组,但这些日本梨品种与来自中国浙江的砂梨品种紧密地聚在一起。同时两个日本梨品种‘博多青’和‘金米糖’与分别来自江苏省和江西省的两个中国的砂梨品种‘硬枝青’和‘魁星麻壳’形成了第8组。这些结果也揭示了

论文目录

  • 缩略语表
  • 中文摘要
  • 第一章 几种主要DNA分子标记技术
  • 1.1 SSR技术
  • 1.2 AFLP技术
  • 1.3 ITS标记技术
  • 1.4 RFLP技术
  • 1.5 RAPD技术
  • 1.6 几种不同分子标记方法的比较
  • 第二章 DNA分子标记技术在梨属等植物中的应用
  • 2.1 标记技术在梨属植物研究中的应用
  • 2.1.1 品种鉴别
  • 2.1.2 亲子关系鉴定
  • 2.1.3 系统关系研究
  • 2.1.4 遗传图谱和分子标记辅助育种
  • 2.2 ITS标记技术在植物系统演化中的应用
  • 2.3 本研究的立题依据和内容
  • 2.3.1 中国白梨的起源
  • 2.3.2 日本梨的起源
  • 2.3.3 胡柚的起源
  • 第三章 材料和方法
  • 3.1 试验材料
  • 3.2 实验方法
  • 3.2.1 DNA提取与纯化
  • 3.2.2 PCR扩增
  • 3.2.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳及银染
  • 3.2.4 谱带记录及数据分析
  • 3.3.5 谱带的回收、克隆和测序
  • 第四章 基于SSR标记技术的梨属演化关系研究
  • 4.1 SSR扩增结果
  • 4.2 SSR测序结果
  • 4.3 SSR的遗传多样性
  • 4.4 基于SSR标记的系统关系分析与讨论
  • 第五章 基于AFLP标记技术揭示梨属植物演化关系
  • 5.1 AFLP扩增结果
  • 5.2 AFLP的遗传多样性
  • 5.3 基于AFLP标记的系统关系分析与讨论
  • 第六章 基于ITS标记技术的胡柚起源研究
  • 6.1 ITS扩增以及重组质粒的鉴定
  • 6.2 胡柚的ITS序列
  • 6.3 胡柚的亲本
  • 6.4 基于ITS标记系统关系分析与讨论
  • 第七章 小结
  • 参考文献
  • Abstract
  • 附录 博士期间参加研究课题和发表论文
  • 致谢
  • 相关论文文献

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