本文主要研究内容
作者冯瑞云,梅超,王慧杰,雷梦林,田翔,侯雅静（2019）在《籽粒苋叶绿体基因组密码子偏好性分析》一文中研究指出：对筛选出的47条籽粒苋叶绿体基因组蛋白编码序列的密码子使用偏性特征进行分析,结果发现:籽粒苋叶绿体基因组密码子第3位碱基GC的含量较低,为27.31%,即第3位密码子富含A和U;有效密码子数（ENC）值在35.25～61.00之间,基因组中多数蛋白编码序列的密码子使用偏好性偏弱。相对同义密码子使用度（RSCU）分析表明,有29个密码子的RSCU>1,其中密码子第3位碱基以A、U结尾有24个,表明密码子的第3位碱基使用偏好于A和U。中性分析发现,GC3与GC12相关性显著,回归曲线斜率为0.403,表明突变对密码子偏性有极大影响;ENC-plot分析发现,大部分基因落在标准曲线及其附近,表明自然选择也一定程度上影响了密码子偏性。进一步的对应性分析发现,第一轴显示了22.98%的差异,为主要影响因素,其与ENC值的相关性达到显著水平,但与GC3、CBI、GCall相关性不显著。综合分析表明,突变是影响籽粒苋叶绿体基因组密码子偏好性的主要因素,但其他因素也可能有一定影响;UUU、UUA、UCU等24个密码子为最优密码子。
Abstract
dui shai shua chu de 47tiao zi li xian xie lu ti ji yin zu dan bai bian ma xu lie de mi ma zi shi yong pian xing te zheng jin hang fen xi ,jie guo fa xian :zi li xian xie lu ti ji yin zu mi ma zi di 3wei jian ji GCde han liang jiao di ,wei 27.31%,ji di 3wei mi ma zi fu han Ahe U;you xiao mi ma zi shu （ENC）zhi zai 35.25～61.00zhi jian ,ji yin zu zhong duo shu dan bai bian ma xu lie de mi ma zi shi yong pian hao xing pian ruo 。xiang dui tong yi mi ma zi shi yong du （RSCU）fen xi biao ming ,you 29ge mi ma zi de RSCU>1,ji zhong mi ma zi di 3wei jian ji yi A、Ujie wei you 24ge ,biao ming mi ma zi de di 3wei jian ji shi yong pian hao yu Ahe U。zhong xing fen xi fa xian ,GC3yu GC12xiang guan xing xian zhe ,hui gui qu xian xie lv wei 0.403,biao ming tu bian dui mi ma zi pian xing you ji da ying xiang ;ENC-plotfen xi fa xian ,da bu fen ji yin la zai biao zhun qu xian ji ji fu jin ,biao ming zi ran shua ze ye yi ding cheng du shang ying xiang le mi ma zi pian xing 。jin yi bu de dui ying xing fen xi fa xian ,di yi zhou xian shi le 22.98%de cha yi ,wei zhu yao ying xiang yin su ,ji yu ENCzhi de xiang guan xing da dao xian zhe shui ping ,dan yu GC3、CBI、GCallxiang guan xing bu xian zhe 。zeng ge fen xi biao ming ,tu bian shi ying xiang zi li xian xie lu ti ji yin zu mi ma zi pian hao xing de zhu yao yin su ,dan ji ta yin su ye ke neng you yi ding ying xiang ;UUU、UUA、UCUdeng 24ge mi ma zi wei zui you mi ma zi 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自中国草地学报的冯瑞云,梅超,王慧杰,雷梦林,田翔,侯雅静，发表于刊物中国草地学报2019年04期论文，是一篇关于籽粒苋论文,叶绿体论文,密码子偏好性论文,最优密码子论文,中国草地学报2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自中国草地学报2019年04期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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