豌豆肌动蛋白异型体(PEAc3)与绿色荧光蛋白(GFP)的融合表达与生化特性分析

豌豆肌动蛋白异型体(PEAc3)与绿色荧光蛋白(GFP)的融合表达与生化特性分析

论文摘要

肌动蛋白普遍存在于真核生物中,在各种肌动蛋白结合蛋白的调控下,参与多种细胞活动,包括细胞分裂、内吞作用、成核作用、细胞信号传导、重力感应及顶端生长、细胞器运动等。在植物细胞中,由多基因家族编码的肌动蛋白存在多种异型体,不同肌动蛋白异型体的表达具有组织器官特异性,在植物生长发育过程中发挥着不同的功能。为了深入了解特定肌动蛋白异型体的功能及其动态调节,本研究利用GFP融合技术对豌豆肌动蛋白异型体3(PEAc3)进行了原核表达与纯化,并研究了其部分生物化学特性,主要研究结果如下:利用RT-PCR的方法克隆了豌豆肌动蛋白异型体PEAc3基因,与随机挑选的7种其他植物肌动蛋白的同源性在90%以上。利用DNAman(Ver6.0)生物信息学软件,建立了豌豆种内异型体之间的生物进化树,为研究真核生物分子进化关系提供依据。根据预测的PEAc3氨基酸序列,推定的PEAc3蛋白MW为41.67kD,pI为5.17,可溶性蛋白没有信号肽序列,以成熟蛋白形式存在,含有肌动蛋白典型的三组序列指纹图谱,推测的PEAc3三维结构图与已有的动物骨骼肌肌动蛋白三维结构相似。为了研究基因融合对PEAc3原核表达的影响,分别构建了四种原核表达载体PEAc3-pET30a, His-PEAc3-pET30a, His-PEAc3-GFP-pET30a和His-GFP-pET30a。利用DNAman软件分析上述载体表达的蛋白质,PEAc3全长为377个氨基酸,MW为41.67kD,pI为5.17;His-PEAc3全长为427个氨基酸,MW为47.13kD,pI为5.56;His-GFP-PEAc3全长为675个氨基酸,MW为74.74kD,pI为5.81;His-GFP全长为296个氨基酸,MW为33.04kD,pI为6.26。利用电穿孔法将构建的载体转入大肠杆菌BL21中,对蛋白的诱导表达条件进行了优化:PEAc3添加IPTG诱导表达的最适菌液浓度为OD600=0.7,IPTG浓度为0.05mmol/L,诱导表达时间为4h,温度为25℃,主要在包涵体中表达;His-PEAc3在菌液浓度为OD600=0.5时添加IPTG,浓度为O.lmmol/L,诱导表达时间为3h,温度为37℃,主要在包涵体中表达;His-PEAc3-GFP在菌液浓度为OD600=0.8时添加IPTG,浓度为0.1mmol/L,诱导表达时间为4h,温度为25℃,在上清和包涵体中都有表达;His-GFP在菌液浓度为OD600=0.5时添加IPTG,浓度为0.05mmol/L,诱导表达时间为4h,温度为37℃,主要在上清中表达。上述结果表明,GFP融合对于PEAc3在原核体系中的可溶性表达有一定的促进作用。利用尿素变性复性,镍柱亲和层析、离子交换层析等方法,分别纯化了上述四种蛋白,并研究了其部分生化特性。通过比较PEAc3、His-PEAc3和His-PEAc3-GFP的聚合曲线和聚合临界浓度,发现His-PEAc3-GFP的聚合动力学与动物骨骼肌肌动蛋白更为接近。DNase I活性测定表明,PEAc3, His-PEAc3和His-PEAc3-GFP对DNase I都有抑制作用,其中His-PEAc3-GFP的抑制效果最明显。His-PEAc3-GFP对肌球蛋白Mg-ATPase活性具有明显激活效果,达到空白对照的五倍。上述研究表明,His和GFP的融合对PEAc3在原核系统中的正确表达与折叠有促进作用,GFP融合没有影响PEAc3的体外生化特性。本课题对豌豆肌动蛋白异型体PEAc3基因进行克隆和表达,对其GFP融合蛋白的部分生化特性进行分析,研究结果对于深入了解高等植物肌动蛋白异型体,探索肌动蛋白结构和功能具有重要意义。利用GFP融合表达不仅可以获得大量有活性的植物肌动蛋白异型体,从而为体外的相关研究提供实验材料,同时利用GFP的绿色荧光,一方面可以方便体外的相关研究,另一方面为研究体内肌动蛋白异型体聚合解聚的动态变化奠定一定的基础。

论文目录

  • 目录
  • CONTENTS
  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 综述
  • 1.1 植物肌动蛋白的组织表达特异性
  • 1.2 植物肌动蛋白体内聚合与调节
  • 1.3 植物肌动蛋白的生物学功能
  • 1.4 植物肌动蛋白的分子进化与保守性
  • 1.5 植物肌动蛋白的研究方法
  • 1.6 本研究的目的与意义
  • 第二章 豌豆肌动蛋白异型体(PEAC3)的基因克隆及生物信息学分析
  • 2.1 引言
  • 2.2 材料与方法
  • 2.2.1 材料
  • 2.2.2 方法
  • 2.2.2.1 豌豆卷须中提取总RNA
  • 2.2.2.2 RT-PCR克隆PEAc3
  • 2.2.2.3 感受态细胞的制备及质粒的转化与提取
  • 2.2.2.4 PEAc3生物信息学分析
  • 2.3 结果与分析
  • 2.3.1 PEAc3基因克隆与鉴定
  • 2.3.2 PEAc3序列的生物信息学分析
  • 2.3.2.1 PEAc3序列同源性分析
  • 2.3.2.2 PEAc3氨基酸序列分析
  • 2.4 讨论
  • 2.5 小结
  • 第三章 豌豆肌动蛋白异型体(PEAC3)及其GFP融合蛋白原核表达与纯化
  • 3.1 引言
  • 3.2 材料与方法
  • 3.2.1 材料
  • 3.2.2 方法
  • 3.2.2.1 原核表达载体的构建
  • 3.2.2.2 原核表达载体的鉴定
  • 3.2.2.3 大肠杆菌的转化与筛选
  • 3.2.2.4 原核表达蛋白的氨基酸序列分析
  • 3.2.2.5 蛋白质诱导表达条件的优化及融合蛋白纯化
  • 3.3 结果与分析
  • 3.3.1 原核表达载体的构建
  • 3.3.1.1 原核表达载体的酶切鉴定
  • 3.3.1.2 原核表达载体的PCR鉴定
  • 3.3.2 原核表达融合蛋白的氨基酸序列分析
  • 3.3.3 蛋白质诱导表达条件的优化及融合蛋白纯化
  • 3.4 讨论
  • 3.5 小结
  • 第四章 豌豆肌动蛋白异型体(PEAC3)及其GFP融合蛋白的生化特性分析
  • 4.1 引言
  • 4.2 材料与方法
  • 4.2.1 材料
  • 4.2.2 方法
  • 4.2.2.1 肌动蛋白聚合曲线的测定
  • 4.2.2.2 肌动蛋白聚合临界浓度的测定
  • 4.2.2.3 单体肌动蛋白对DNase Ⅰ活性的影响
  • 4.2.2.4 聚合肌动蛋白对肌球蛋白Mg-ATPase活性的影响
  • 4.3 结果与分析
  • 4.3.1 肌动蛋白聚合曲线
  • 4.3.2 肌动蛋白聚合临界浓度
  • 4.3.3 单体肌动蛋白对DNase Ⅰ活性的抑制
  • 4.3.4 聚合肌动蛋白对肌球蛋白Mg-ATPase活性的激活
  • 4.4 讨论
  • 4.5 小结
  • 结论
  • 今后工作思路
  • 参考文献
  • 致谢
  • 攻读学位期间发表的文章
  • 相关论文文献

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