小果油茶种内类型划分、评价及亲缘关系研究

小果油茶种内类型划分、评价及亲缘关系研究

论文摘要

小果油茶(Camellia meiocarpa Hu.)是我国栽培面积和年产量仅次于普通油茶的油料树种,但对其遗传改良研究仍处于初级阶段。小果油茶为异花授粉植物,种内变异类型极为丰富。为充分挖掘和利用现有的遗传变异,本文在前期充分调查的基础上,对小果油茶种内自然变异类型进行了划分,同时针对小果油茶分类地位仍存在异议的问题,从孢粉学、表型、基因组DNA和基因转录水平上对典型小果油茶类型的亲缘关系进行了研究。主要结论如下:1.根据小果油茶生物学特性及种群遗传特点,结合前期的调查资料,初步对小果油茶种内变异类型进行了划分。结果表明:小果油茶树体、果实、叶片、花等表型性状变异十分丰富,其中树体性状的变异系数最大(平均CV=43.79%),其次是果实性状(平均CV为26.09%),叶和花性状的变异系数相对较小,平均为16.84%和16.53%。综合R型聚类和主成分分析结果及成熟期等生态表现,提出以果实横径、果皮厚度和成熟期作为类型划分的指标,将小果油茶初步划分为10个类型。2.比较了部分典型小果油茶类型和普通油茶的花粉形态,并分析其与山茶属物种间的亲缘关系,结果表明:不同类型小果油茶的花粉均具有山茶属植物花粉的种属特征,即:花粉粒为长形球、近球形,赤道面观长椭圆形,极面观三裂圆形,具三孔沟,但花粉粒的外观表面纹饰特征因不同类型而异。相关分析表明,不同小果油茶类型的单果质量、鲜出籽率与花粉粒极轴长(P值)呈显著负相关,与沟间距离呈显著正相关,因此可以通过花粉形态特征来鉴别小果油茶类型。通过比较小果油茶和36个山茶物种间的花粉形态特征,发现小果油茶花粉大小与油茶组、红山茶组的大部分种相似,而与连蕊茶组、短柱茶组、糙果茶组等大部分种相差甚远,初步说明,小果油茶与油茶组和红山茶组的大部分种有较近的亲缘关系。3.对部分典型小果油茶类型和42个山茶属油用类物种间的亲缘关系进行分析。结果表明:46个物种(类型)的表型性状变异极为丰富,叶片、花、果实及其经济性状等39个性状的变异系数达4.95%159.41%,尤其是单果质量和单果籽质量的变异系数更是高达159.41%和134.72%;通过聚类分析将46个物种(类型)分为2大类群,其中小果油茶大果薄皮立冬籽(龙眼茶)、中果薄皮霜降籽(羊屎茶)、小果薄皮寒露籽(珍珠茶)和中果薄皮寒露籽(宜春白皮中籽)先与钝叶短柱茶聚在一起,再与短柱茶、粉红短柱茶、小果短柱茶、普通油茶等12个物种聚为一个亚类,说明小果油茶的表型性状和这些物种的表型性状相似性较高。4、采用AFLP标记对部分典型小果油茶类型和42个山茶属油用类物种间的亲缘关系进行了分析。结果表明:18对AFLP引物组合共检测到642条多态性条带,多态性条带占95.69%;小果油茶羊屎茶与珍珠茶遗传相似系数最大,为0.9539,越南油茶与滇北红山茶遗传相似系数最小(0.5272)。通过聚类分析将46个物种(类型)划分为5个类群:越南油茶和小果短柱茶分别单独为一类;糙果茶组聚为一类;14个红山茶属物种和短柱茶组中果实性状较为类似的陕西短柱茶、攸县油茶和闽鄂山茶聚为一大类;小果油茶与除小果短柱茶外的油茶组、短柱茶组部分种聚为一类。与形态学标记相比较,发现两种标记的聚类结果并不完全一致,但在一定程度上可以互补。5.以小果油茶和普通油茶的嫩叶及种仁为材料,建立了适合油茶的cDNA-AFLP反应体系。结果表明:总RNA中分离的mRNA经合成双链cDNA后,用限制性内切酶EcoRⅠ和MseⅠ在37℃下5h内完全酶切,经5U T4连接酶16℃连接的产物稀释10倍后直接用于预扩增;在20μL选择性扩增体系中,以预扩增产物稀释30倍为模版、dNTP (10mM)1.5μL、引物(10μM)1.0μL、Taq酶用量1.25U时的扩增效果较好。利用优化体系成功筛选出61对可以获得带型丰富且重复性好的引物组合。6.为进一步分析典型小果油茶类型间差异的遗传学基础,本文尝试用cDNA-AFLP技术对小果油茶基因表达差异进行分析。138对引物组合共扩增出3649条转录衍生片段(TDFs),其中差异显示的TDFs有3557个,多态率高达97.48%。研究发现在大果薄皮立冬籽龙眼茶和普通油茶中特异表达的TDFs占总差异带的4.27%,在龙眼茶和宜春白皮中籽中特异表达的TDFs占4.53%,在龙眼茶和羊屎茶中特异表达的TDFs有1.57%,在龙眼茶、羊屎茶和宜春白皮中籽中均特异表达的TDFs占1.88%,而在龙眼茶、宜春白皮中籽和普通油茶中均特异表达的TDFs占3.54%,说明龙眼茶与普通油茶和宜春白皮中籽的亲缘关系可能较近,而与羊屎茶的亲缘关系可能相对较远。基于TDFs表达模式差异的多态性将5个参试材料分为3类,其中龙眼茶和宜春白皮中籽聚为一类,羊屎茶和珍珠茶归为一类,普通油茶独立为一类,这与基因组DNA的AFLP分析结果一致。差异TDFs经回收及测序,获得了789个差异基因片段。经BlastX/N同源性比对,有716个在GeneBank中找到了同源序列,其功能主要涉及信号转导、转录因子、蛋白质合成、代谢、运输、细胞防御等方面。以上研究结果为小果油茶的分类、遗传改良、种质资源保护及进一步开发利用提供了理论依据。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 绪论
  • 1.1 引言
  • 1.1.1 研究背景
  • 1.1.2 研究目的和意义
  • 1.2 国内外研究现状及评述
  • 1.2.1 小果油茶研究现状
  • 1.2.2 其他相关研究现状
  • 1.3 研究目标和主要研究内容
  • 1.3.1 研究目标
  • 1.3.2 主要研究内容
  • 1.3.3 经费来源
  • 1.4 研究技术路线
  • 第二章 小果油茶种质资源形态变异及类型划分
  • 2.1 材料与方法
  • 2.1.1 材料
  • 2.1.2 研究方法
  • 2.1.3 数据处理
  • 2.2 结果与分析
  • 2.2.1 小果油茶生物学特性
  • 2.2.2 单性状分类
  • 2.2.3 形态特征的变异
  • 2.2.4 表型性状的相关性分析
  • 2.2.5 小果油茶类型划分指标选择
  • 2.2.6 小果油茶种内自然类型的划分
  • 2.2.7 不同小果油茶类型的形态差异
  • 2.2.8 小果油茶优良类型选择
  • 2.3 讨论与小结
  • 第三章 不同小果油茶类型花粉形态及亲缘关系分析
  • 3.1 材料和方法
  • 3.1.1 试验材料
  • 3.1.2 试验方法
  • 3.2 结果与分析
  • 3.2.1 不同类型小果油茶果实形态比较
  • 3.2.2 不同类型小果油茶花粉形态比较
  • 3.2.3 小果油茶果实性状与花粉粒特征指标的相关性
  • 3.2.4 不同类型小果油茶与其近缘种间的亲缘关系分析
  • 3.3 小结与讨论
  • 第四章 不同小果油茶类型亲缘关系的形态学分析
  • 4.1 材料和方法
  • 4.1.1 材料
  • 4.1.2 形态性状观察与测定
  • 4.1.3 数据处理
  • 4.2 结果与分析
  • 4.2.1 表型性状及其赋值
  • 4.2.2 果实性状差异
  • 4.2.3 叶性状差异
  • 4.2.4 花性状差异
  • 4.2.5 基于形态学标记的聚类分析
  • 4.3 小结与讨论
  • 第五章 不同小果油茶类型亲缘关系的 AFLP 分析
  • 5.1 材料和方法
  • 5.1.1 材料
  • 5.1.2 试验方法
  • 5.1.3 数据处理
  • 5.2 结果与分析
  • 5.2.1 AFLP 多态性分析
  • 5.2.2 遗传相似性分析
  • 5.2.3 基于 AFLP 指纹图谱的聚类分析
  • 5.2.4 基于 AFLP 数据的主坐标分析
  • 5.3 小结与讨论
  • 第六章 油茶 cDNA-AFLP 技术反应体系建立的研究
  • 6.1 材料和方法
  • 6.1.1 材料
  • 6.1.2 方法
  • 6.2 结果与分析
  • 6.2.1 油茶总 RNA 的质量
  • 6.2.2 cDNA 酶切及预扩增结果
  • 6.2.3 选择性扩增结果
  • 6.2.4 引物筛选结果
  • 6.2.5 差异片段的回收及检测
  • 6.3 小结与讨论
  • 第七章 小果油茶典型类型的 cDNA-AFLP 分析
  • 7.1 材料和方法
  • 7.1.1 材料
  • 7.1.2 方法
  • 7.2 结果与分析
  • 7.2.1 RNA 提取结果
  • 7.2.2 cDNA-AFLP 分析
  • 7.2.3 差异片段的回收
  • 7.2.4 差异片段的克隆与测序
  • 7.2.5 差异片段的序列比对
  • 7.2.6 差异表达基因的功能分类
  • 7.2.7 半定量 RT-PCR 验证
  • 7.3 小结与讨论
  • 第八章 结论与展望
  • 8.1 本研究主要结论
  • 8.2 论文创新之处
  • 8.3 展望
  • 参考文献
  • 在读期间的学术研究
  • 致谢
  • 相关论文文献

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