吸水链霉菌10-22与5008中井岗霉素生物合成机理的研究

吸水链霉菌10-22与5008中井岗霉素生物合成机理的研究

论文摘要

有效霉素是一种氨基糖苷类抗生素,在防治水稻纹枯病中被广泛使用。在已调出吸水链霉菌5008中有效霉素部分生物合成基因簇的研究基础上,通过基因置换试验失活可能的2-表-5-表-有效醇酮合成酶基因valA,对基因置换菌株的生物活性测定及HPLC分析均表明此菌株失去合成有效霉素的能力。有效霉素生物合成基因簇中有一个可能的转运蛋白基因valH,生物信息学分析表明它具有12个跨膜螺旋,属于主要异化超家族(The Major Facilitator Superfamily),推测ValH可能的功能是负责将合成好的有效霉素转运到细胞外,通过基因置换试验中断valH后,突变株(JXH4)仍然能够产生有效霉素,但是产量下降约17%,将valH基因构建在强启动子下回补valH突变株JXH3后,有效霉素的产量与野生型相比,提高20%。将吸水链霉菌10-22的一系列突变株染色体缺失范围与野生型染色体物理图谱比较发现,染色体上某些片段的缺失与5102-Ⅰ号素的合成密切相关,5102-Ⅰ号素是吸水链霉菌10-22产生的一种与有效霉素类似的一种抗生素,分析28个失去抑制水稻纹枯生长能力的菌株发现,这些菌株染色体缺失大小是不同的,但有一个共同的特点就是都没有一个300 kb的AseI-F片段,在S. lividans ZX1异源表达实验显示300 kb AseI-F片段中的一个文库质粒的发酵产物具有抑菌活性。并且以2-表-5-表-有效醇酮合成酶基因valA为探针杂交实验也证实了5102-Ⅰ号基因合成簇的位置, valA的同源基因(orf1)缺失后的基因改造菌株(JXH4)失去抑菌活性,回补后恢复产素能力。同时,在鉴定5102-Ⅰ抗生素结构时发现它与有效霉素相同,为方便描述将其命名为井岗霉素。10-22产生的井岗霉素与5008产生的有效霉素相比,液体发酵产量相差悬殊,分析两者的基因簇发现,大部分的合成基因都高度同源,但两个基因簇各有自己可能的调节基因,敲除井岗霉素基因簇中的可能的调节基因jin2后,10-22产量无变化,把有效霉素基因簇中已经证明的调节基因valP和valQ导入10-22后,井岗霉素产量上升约40%。为探明井岗霉素基因簇和有效霉素基因簇在产量上差别悬殊的可能原因,分别将两个基因簇整合到异源宿主Streptomyces lividans染色体上,有效霉素异源表达菌株JXH21产量与原始产生菌5008接近,井岗霉素异源表达菌株JXH10产量约为JXH21的1/4,但是远高于原始产生菌10-22。由此推测井岗霉素基因簇在菌株10-22产素能力低下的主要原因为菌株本身,但是有效霉素基因簇与井岗霉素基因簇基因簇相比,其基因簇中内部存在导致高产的原因。井岗霉素基因簇在异源宿主Streptomyces lividans中整合表达的菌株JXH10可以产生与有效霉素相同的几个组分,敲除JXH10中井岗霉素基因簇中的可能与B组分形成相关的氧化还原酶jinJ基因后得到的突变菌株JXH12仍然可以产生B组分,进一步分析有效霉素基因簇中异源表达菌株XH-9和XH-6暗示可能形成B组分并不需要特异的羟化酶,同时探讨了有效霉素可能的合成机制。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第一章 文献综述
  • 第1节 链霉菌简介
  • 第2节 氨基糖苷类抗生素概论
  • 第3节 肌-肌醇起源的氨基糖苷类抗生素
  • 第4节 2-脱氧-蟹-肌醇起源的氨基糖苷类抗生素
  • 第5节 2-表-5-表-有效醇酮系列的氨基糖苷类抗生素
  • 第6节 环戊醇类型的的氨基糖苷类抗生素
  • 第7节 井岗霉素概论
  • 第二章 实验材料和方法
  • 第1节 实验材料
  • 第2节 实验方法
  • 第三章 2-表-5表有效醇酮合成酶valA基因功能的确定
  • 第四章 有效霉素生物合成基因簇中转运蛋白合成基因valH 功能初探
  • 第五章 吸水链霉菌10-22 中井岗素生物合成基因簇的定位
  • 第六章 井岗霉素生物合成基因簇的测定和功能分析
  • 第1节 井岗霉素生物合成基因簇全序列的获得
  • 第2节 井岗霉素基因簇分析
  • 第3节 有效霉素/井岗霉素生物合成途径推断
  • 第七章 对吸水链霉菌10-22 产素能力低下的初步研究
  • 第1节 可能的调节基因ji112对井岗霉素产量的影响
  • 第2节 有效霉素基因簇中调节基因对10-22 中井岗霉素产量的调节
  • 第3节初探基因位置效应对产量的影响
  • 第八章 在异源宿主中研究井岗霉素/有效霉素的生物合成
  • 第1节 在S. lividans 中异源表达井岗霉素生物合成基因簇
  • 第2节 在异源宿主中对井岗霉素/有效霉素的生物合成途径的研究
  • 第3节 在 S. lividans 中比较井岗霉素和有效霉素生物合成基因簇
  • 第九章 总结与展望
  • 参考文献
  • 致谢
  • 攻读学位期间发表的学术论文及奖励
  • 相关论文文献

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