华东地区虎纹蛙三个地理种群的遗传多样性与遗传结构研究

论文摘要

虎纹蛙（Hoplobatrachus rugulosus）属于两栖纲无尾目叉舌蛙科虎纹蛙属物种,广泛分布于中国南方地区。由于生境的片段化和丧失以及过度的人为捕杀,其野外种群分布范围和数量都在急剧的缩小。本研究利用GenBank数据库和本实验室发表的7对虎纹蛙特异性微卫星（Microsatellite）（?）|物,研究测定了3个虎纹蛙地理种群（福建种群、安徽种群和江西种群）的遗传多样性和遗传结构。研究结果表明：1、7个微卫星座位均表现出较高的遗传多样性。在106个样品中共检测到55个等位基因,各位点等位基因的数目在6至10个之间。每个基因座上的平均等位基因为7.86个。所有位点的多态信息含量均大于0.5,平均PIC为0.825。各位点观测杂合度和期望杂合度分别在在0.637-0.840和0.811-0.872之间,平均观测杂合度和平均期望杂合度分别为0.739和0.849。2、对所有位点进行哈迪温伯格平衡和连锁不平衡检测,结果显示有61.9%的位点表现为显著或极显著的偏离哈迪温伯格平衡（P<0.01或P<0.05）,而各位点间并未表现出明显的连锁不平衡现象。P值均大于0.05。3、通过IAM、TPM或SMM三种突变模型对各种群瓶颈效应进行检测,结果显示：江西、安徽和福建3个种群近期都经历种群瓶颈效应。4、利用固定指数（Fst）和Fisher’s确切性检验测定了三个种群间的遗传分化程度,结果发现微卫星位点在各种群间并未发生明显的遗传分化,P值均大于0.001。5、根据Nei’s无偏差遗传距离和构建的UPGMA聚类图显示,安徽和江西种群的遗传距离最近,为0.1146,安徽和福建种群的遗传距离最远,为0.1437。6、对三个种群基因流的研究显示：Nm值均大于1,各地理种群间的基因流较高。同时各地理种群的Fis正值较多,说明在各种群内部的个体间存在着广泛的近交现象。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 目录
• 符号说明
• 第一章 绪论
• 1 遗传多样性与分子标记概述
• 1.1 生物遗传多样性的理论和意义
• 1.2 遗传多样性的评估方法
• 1.3 常用分子标记概述
• 2 微卫星综述
• 2.1 微卫星的定义和命名
• 2.2 微卫星的结构和类型
• 2.3 微卫星位点的获取方法
• 2.4 微卫星标记的优点和缺点
• 2.5 微卫星标记的应用
• 3 微卫星在两栖类研究中的现状
• 4 虎纹蛙研究综述
• 4.1 虎纹蛙的分布与保护状况
• 4.2 虎纹蛙的研究现状
• 5 本研究的目的和意义
• 第二章 材料与方法
• 1 实验材料
• 1.1 试验样本
• 1.2 主要仪器设备
• 1.3 主要药品和耗材
• 1.4 常规溶液及试剂配制及保存
• 2 实验方法
• 2.1 基因组DNA的提取
• 2.2 PCR扩增反应
• 2.3 PCR产物检测
• 2.4 数据分析
• 第三章 实验结果与分析
• 1 虎纹蛙模版DNA的检测
• 2 微卫星PCR扩增结果及检测
• 3 遗传多样性结果分析
• 第四章 讨论
• 1 样本数量及微卫星的筛选
• 2 遗传多样性
• 3 遗传分化与基因流
• 4 哈迪温伯格平衡与连锁不平衡
• 5 瓶颈效应
• 6 遗传距离
• 第五章 展望
• 参考文献
• 致谢
• 攻读学位期间发表的学术论文目录
• 参加的科研项目