水稻卷叶基因rlt的克隆及OsAGO1a的RNAi分析

水稻卷叶基因rlt的克隆及OsAGO1a的RNAi分析

论文摘要

叶片是植物进行光合作用的主要器官,对植物的发育起着重要的作用。水稻叶片的姿态(长、宽、卷曲度等)影响整个植株的形态,关系到群体株型结构的塑造,是高产育种关心的主要对象之一。水稻叶片的适度卷曲能提高叶片直立性,进而提高群体透光率,改善群体中后期的基部光照条件,有利于水稻产量的提高。然而,过度卷曲的叶片降低了单位面积的光强,不利于冠层的光合作用。本文在前人的研究基础之上,克隆了水稻卷叶rl(t)基因,并研究了水稻叶片的最适卷曲度。此外,本文通过反向遗传学方法鉴定了一个新的水稻卷叶相关基因OsAG01a。最后,在基因的功能研究过程中,本文探讨了一种载体多克隆位点改造的新方法。主要研究结果如下:1)叶片的适度卷曲是水稻理想株型育种中最重要的农艺性状之一。先前的研究表明:rl(t)基因在杂合状态下使叶片适度卷曲(卷曲度约30%),具有较高的育种利用价值,能有效地增加水稻产量。本文实现了rl(t)基因的克隆,并初步研究了其控制叶片卷曲的功能。序列分析表明:在rl(t)基因精细定位的1lkb区间内仅存在一个G>T的单碱基替换,该单碱基替换位于定位区间内唯一的预测基因Roc5(Rice outermost cell-specific)的3’末端非翻译区(3’-UTR)。荧光实时定量PCR分析表明突变体中rl(t)基因的表达量明显高于野生型。RNA干扰实验和过表达实验证实:rl(t)基因的表达量的高低控制了叶片中泡状细胞的小和大,进而控制叶片近轴面或远轴面卷曲的方向以及叶片卷曲程度的大小。这表明rl(t)基因以剂量效应方式控制水稻的卷叶性状。生物信息学分析表明:在rl(t)基因以及其他HD-ZIP Ⅳ (homeodomain leucine zipper classV)家族转录因子的3’末端非翻译区中存在一个高度保守的17个核苷酸的GU富含区元件(GU-rich element)。基于哺乳动物中GU富含区元件调节mRNA稳定性的模型,我们推测rl(t)基因中GU富含区元件的单碱基突变导致ri(t)基因的过量表达进而导致叶片近轴面卷曲。本文的研究对ri(t)基因控制叶片卷曲的分子机制提供了一个新的视野。2)通过调节水稻卷叶剂量效应基因rl(t)的表达量,获得叶片近轴面卷曲或远轴面卷曲的8个不同叶片卷曲程度的卷叶近等基因系,借此研究叶片卷曲对水稻生长的影响。结果表明:叶片的正卷和反卷均能提高叶片直立度,并通过降低叶片披垂角来降低叶片的披垂度;叶片卷曲度与产量间的模型拟合表明:日本晴的产量与叶片卷曲度之间呈抛物线关系,当叶片卷曲度为5.9%时,产量最高,这说明水稻品种日本晴的叶片最适卷曲度为5.9%左右。讨论了采用相同的策略,研究并确定不同类型水稻品种最适卷曲度的可行性。3)AGO蛋白是RNA诱导沉默复合体的核心元件,在植物生长发育过程中发挥着重要作用。本研究通过分别特异地扩增OsAGO1a基因中第2外显子和第11-12外显子的片段,构建了两个干涉载体OsAGO1aI-1E、OsAGO1aI-2E。利用农杆菌介导法转化水稻品种日本晴,抑制OsAGO1a基因的表达,借此研究OsAGO1a的功能及其对水稻生长发育的影响。结果表明:抑制OsAGO1a的表达导致叶片的近轴面卷曲而对其他主要农艺性状的影响不大。4)为了探寻一种快速的、便捷的改造已知载体多克隆位点的方法,我们应用一对5’末端分别添加了多个酶切位点的引物扩增任一已知DNA片段,用两端的限制性酶酶切后连接至载体多克隆位点中,从而引入两个新的酶切位点。我们将这一方法称为衔接子引物-PCR引入法。酶切结果证实:预先设计的酶切位点已替换至载体的多克隆位点,且引入的酶切位点能被顺利切割。这说明衔接子引物-PCR引入法是一种改造已知载体多克隆位点的可行的方法。

论文目录

  • 目录
  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 水稻卷叶性状的研究概况
  • 引言
  • 1 植物叶片卷曲的机理
  • 1.1 非生物胁迫导致叶片卷曲
  • 1.2 生物胁迫导致叶片卷曲
  • 1.3 从物理化学角度解释叶片卷曲的原因
  • 1.4 从分子生物学角度解释叶片卷曲的原因
  • 1.4.1 生理结构异常导致叶片卷曲
  • 1.4.2 极性发育异常导致叶片卷曲
  • 1.4.3 小RNA对卷叶的作用
  • 2 水稻卷叶性状的效应
  • 2.1 卷叶的物理效应
  • 2.2 卷叶的生理生态效应
  • 2.3 卷叶的其他效应
  • 3 水稻卷叶的遗传学研究
  • 3.1 干旱胁迫下卷叶基因的QTL定位
  • 3.2 卷叶主效基因的研究
  • 3.3 卷叶性状及其遗传的复杂性
  • 4 水稻卷叶的种质资源及其利用价值
  • 4.1 水稻卷叶的种质资源
  • 4.2 卷叶资源在育种实践中的应用
  • 5 参考文献
  • (t)基因的克隆'>第二章 水稻卷叶rl(t)基因的克隆
  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 引言
  • 1 材料与方法
  • 1.1 植物材料
  • 1.2 叶片卷曲度的产量
  • 1.3 DNA提取
  • 1.4 RT-PCR分析
  • 1.5 载体构建和遗传转化
  • 1.6 显微观察
  • 2 结果与分析
  • (t)突变体与野生型中编码同样的HD-GL2类转录因子'>2.1 rl(t)突变体与野生型中编码同样的HD-GL2类转录因子
  • (t)基因的表达量高于野生型'>2.2 突变体中rl(t)基因的表达量高于野生型
  • (t)基因的过量表达导致叶片近轴面卷曲'>2.3 rl(t)基因的过量表达导致叶片近轴面卷曲
  • (t)基因的表达导致叶片远轴面卷曲'>2.4 抑制rl(t)基因的表达导致叶片远轴面卷曲
  • (t)基因表达量与叶片卷曲度呈二次相关关系'>2.5 rl(t)基因表达量与叶片卷曲度呈二次相关关系
  • (t)基因3’UTR中高度保守的GU富含区元件中存在一个单碱基突变'>2.6 rl(t)基因3’UTR中高度保守的GU富含区元件中存在一个单碱基突变
  • 3 讨论
  • 3.1 卷叶突变体及其育种利用价值
  • 3.2 水稻叶片卷曲的机制
  • ((t)基因3’UTR的GU富含区元件与mRNA稳定性的关系'>3.3 rl((t)基因3’UTR的GU富含区元件与mRNA稳定性的关系
  • 4 参考文献
  • 第三章 不同叶片卷曲度对水稻产量的影响
  • 摘要
  • Abstract
  • 引言
  • 1 材料与方法
  • 1.1 供试材料
  • 1.2 实验设计
  • 1.3 调查项目及方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 日本晴背景不同叶片卷曲程度卷叶系的获得
  • 2.2 卷叶对基本农艺性状的影响
  • 2.3 卷叶对植株茎蘖动态的影响
  • 2.4 卷叶对经济性状的影响
  • 2.5 叶片卷曲度与产量的模型拟合
  • 3 讨论
  • 4 参考文献
  • 第四章 卷叶相关基因OsAGO1a的RNAi分析
  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 引言
  • 1 材料与方法
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 水稻AGO基因的生物信息学分析
  • 1.3 载体构建及遗传转化
  • 1.4 田间管理及表型鉴定
  • 1.5 实时定量PCR分析
  • 2 结果与分析
  • 2.1 OsAGO1a基因的生物信息学分析
  • 2.2 水稻OsAGO1a基因的表达模式分析
  • 2.3 抑制OsAGO1a基因的表达导致叶片卷曲
  • 2.4 OsAGO1a基因对水稻主要农艺性状的影响
  • 3 讨论
  • 3.1 OsAGO1基因与叶片极性发育的关系
  • 3.2 未发现OsAGO1a存在明显不良的基因多效性
  • 3.3 关于OsAGO1a的育种利用价值
  • 4 参考文献
  • 第五章 基因克隆中载体多克隆位点改造方法的探索
  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 引言
  • 1 材料与方法
  • 1.1 材料
  • 1.1.1 实验材料
  • 1.1.2 试剂
  • 1.1.3 培养基
  • 1.2 方法
  • 2 结果与分析
  • 2.1 植物表达载体pCAMBIA1301/Ubi多克隆位点的改造
  • 2.1.1 衔接子引物的设计
  • 2.1.2 扩增片段与载体的连接及验证
  • 2.2 植物表达载体pCAMBIA2300多克隆位点的改造
  • 2.2.1 衔接子引物的设计
  • 2.2.2 扩增片段与载体的连接及验证
  • 2.2.3 辅助片段的选择
  • 3 讨论
  • 4 参考文献
  • 附录
  • 附录1:TPS法少量提取水稻核基因组DNA
  • 附录2:RNA完整性的甲醛凝胶电泳检测
  • 致谢
  • 博士研究生期间发表的论文
  • 相关论文文献

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