陕西省主要保存家蚕品种亲缘关系的AFLP分析

论文摘要

家蚕（Bombyx mori）作为鳞翅目类的模式生物和重要的经济昆虫，其起源进化问题一直受到关注，这也是家蚕遗传育种的理论基础。家蚕存在多种生态类型和系统类群，如中国系统、日本系统、热带系统和欧洲系统等。家蚕品种资源间的亲缘关系和遗传距离，对家蚕起源进化研究，种质资源鉴定、保存和利用，家蚕实用品种的亲本选配等，都有重要的理论和现实意义。为了更好地开发西部蚕区家蚕品种资源，以及在家蚕新品种选育中的利用提供分子水平的理论依据。本研究选择陕西省保存的具有代表性的53份家蚕品种资源，利用AFLP分子标记技术分析其亲缘关系和遗传距离。1适于家蚕滞育期蚕卵DNA提取方法的建立DNA提取是家蚕分子遗传学研究的基本技术，也是品种鉴定和纯度检测研究中较为常见的问题。本实验中使用3种DNA抽提方法进行对比，建立适合滞育期蚕卵的基因组DNA提取方法，达到快速高效满足分子实验要求的目标。2家蚕遗传多样性分析通过筛选出的14对引物组合对53个品种基因组DNA样品的AFLP扩增共获得535条带，其中多态性条带数472条，每对引物扩增的多态性比率为88.22%，显示出不同家蚕品种间存在丰富的遗传多样性。3家蚕遗传相似性分析与聚类分析使用NTSYS-pc2.1软件计算各家蚕品种间遗传距离。53个家蚕品种间遗传距离在0.07280.6019间。基于UPGMA法及NJ法聚类分析得到53个家蚕品种聚类分析图，以及各个系统的聚类分析图。中系品种单独聚为一类，欧系品种和日系品种聚为一大类。其中基于UPGMA法聚类一化性三眠的西北地方品种明显区别于其它蚕品种聚为不同的类群。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 第一章 文献综述
• 1.1 分子标记技术
• 1.1.1 限制性内切酶片段长度多态性（RFLP）
• 1.1.2 DNA随机扩增多态性（RAPD）
• 1.1.3 微卫星标记（SSR）
• 1.1.4 扩增片段长度多态性（AFLP）
• 1.2 家蚕遗传多样性的研究进展
• 1.2.1 RFLP的研究
• 1.2.2 RAPD的研究
• 1.2.3 SSR的研究
• 1.2.4 AFLP的研究
• 1.3 本研究意义
• 第二章 材料与方法
• 2.1 材料
• 2.1.1 实验材料
• 2.1.2 主要试剂与溶液配制
• 2.1.3 主要仪器与设备
• 2.1.4 分析软件
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 家蚕基因组DNA提取方法的筛选
• 2.2.2 AFLP反应体系
• 2.2.3 数据统计
• 第三章 结果与分析
• 3.1 家蚕基因组DNA提取方法的选择
• 3.1.1 基因组DNA浓度及琼脂糖凝胶电泳检测
• 3.1.2 PCR扩增产物0.8%琼脂糖凝胶电泳检测
• 3.2 限制性内切酶的选择及酶切产物琼脂糖电泳检测
• 3.3 扩增产物电泳检测
• 3.3.1 预扩增产物的琼脂糖凝胶电泳检测
• 3.3.2 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳检测
• 3.4 53 个家蚕品种的 AFLP 分析
• 3.4.1 选择性引物的筛选
• 3.4.2 14 对AFLP引物对53个家蚕品种基因组DNA扩增产物的多态性
• 3.4.3 53 个家蚕品种的UPGMA聚类和NJ聚类分析
• 3.4.4 中系家蚕品种的UPGMA聚类和NJ聚类分析
• 3.4.5 日系家蚕品种的UPGMA聚类和NJ聚类分析
• 3.4.6 欧系家蚕品种的UPGMA聚类和NJ聚类分析
• 第四章 讨论
• 4.1 建立适于家蚕滞育期蚕卵DNA提取方法
• 4.2 家蚕AFLP扩增产物的遗传多样性
• 4.3 家蚕遗传相似性分析和聚类分析
• 第五章 结论
• 参考文献
• 致谢
• 附录
• 作者简介