利用微卫星标记分析新疆地方斗鸡类群的遗传多样性

利用微卫星标记分析新疆地方斗鸡类群的遗传多样性

论文摘要

本试验利用8个微卫星座位分析了新疆三个地方(吐鲁番、喀什和伊犁)斗鸡类群的等位基因频率、多态信息含量、基因杂合度和有效等位基因数等群体遗传变异参数,研究结果如下:1、每一微卫星座位的等位基因频率在不同类群之间存在着明显的差异,表现出等位基因在各类群中的分布不平衡性。8个微卫星位点共检测到77个等位基因,平均基因数为9.63个。2、8个微卫星基因座中,MCW0157座位多态性最丰富,平均遗传杂合度为0.8569,ADL0298座位多态性最差,平均遗传杂合度为0.6723。3个斗鸡类群中,吐鲁番斗鸡遗传杂合度最高(0.8255),伊犁斗鸡遗传杂合度最低(0.7874)。3、8个微卫星座位在3个试验鸡中表现出较高的多态信息含量,均大于0.5,说明试验所用的8个微卫星座位均为高度多态,可作为有效的遗传标记用于鸡群体遗传多样性的分析。4、所有类群间的平均遗传距离为0.2886(0.2051~0.3859),其中吐鲁番斗鸡和喀什斗鸡之间的Ds遗传距离最近为0.2051,伊犁斗鸡和喀什斗鸡之间的Ds遗传距离最远为0.3859。5、运用SPSS13.0软件进行单因素方差分析并采用LSD法进行显著性检验(P<0.05表示差异显著,P<0.01表示差异极显著)分析新疆三个地方斗鸡的体尺性状的关系,发现吐鲁番斗鸡、喀什斗鸡和伊犁斗鸡在体尺方面差异显著或极显著。综上所述,8个微卫星基因座多态信息含量丰富,适合作为新疆3个斗鸡类群的遗传标记,可用于其多样性评估、遗传距离分析、性状选育等研究领域。新疆3个斗鸡类群遗传多态性丰富,遗传变异较大,均具有较大的遗传潜力,可依据其特有的基因型选育出各具特色的新疆3个地区斗鸡新品种(系)。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一篇 文献综述
  • 1. 斗鸡的历史发展和研究现状
  • 1.1 我国斗鸡的历史及发展状况
  • 1.2 国外斗鸡的发展历史与现状
  • 1.3 吐鲁番斗鸡的历史及现状
  • 2. 群体遗传多样性的研究方法
  • 2.1 传统遗传标记
  • 2.2 DNA 分子标记
  • 3. 微卫星DNA 结构、特性及应用
  • 3.1 微卫星DNA 结构及特点
  • 3.2 微卫星位点多态性的形成机理
  • 3.3 微卫星位点的功能
  • 3.4 微卫星多态性的数据分析
  • 4. 微卫星标记在家禽遗传育种上的应用
  • 4.1 基因定位及构建基因组图谱
  • 4.2 群体遗传结构分析和群体间遗传距离
  • 4.3 与生产性状的连锁分析及数量性状位点(QTL)定位
  • 4.4 鉴定个体间亲缘关系
  • 4.5 监测育种和遗传操作效应
  • 5. 本实验研究的目的和意义
  • 第二篇 试验研究
  • 1. 材料和方法
  • 1.1 试验材料
  • 1.2 试验方法
  • 1.3 统计方法
  • 2. 结果与分析
  • 2.1 DNA 提取结果和PCR 扩增产物检测
  • 2.2 扩增结果与多态性
  • 2.3 等位基因频率与遗传变异分析
  • 2.4 新疆三个地方斗鸡类群体重、体尺性状的比较
  • 2.5 微卫星标记与新疆三个地方斗鸡类群体重、体尺的相关性初探
  • 3. 讨论
  • 3.1 关于聚丙烯酰胺凝胶电泳和带型的判读
  • 3.2 关于种群内的遗传变异
  • 3.3 关于微卫星标记数目和试验群体大小的问题
  • 4. 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简介
  • 在学期间发表的文章
  • 导师评阅表
  • 相关论文文献

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