水稻灌浆期控制叶绿素含量的QTL分析

水稻灌浆期控制叶绿素含量的QTL分析

论文摘要

以籼稻TN1与粳稻春江06(CJ06)为亲本的包括120个株系的DH群体作为研究材料,利用已构建的含226个SSR标记的遗传图谱为基础,测定DH群体不同株系及双亲4个不同灌浆时期的顶部三叶叶绿素含量,共检测到7个与叶绿素含量有关的QTL,主要分布在第4,6和8染色体上。从不同叶片来看,倒三叶的QTL主要在灌浆早期表达,而在灌浆后期逐渐被倒二叶和剑叶所代替;从不同的检测时期看,在第一和第二次检测过程中各发现4个QTL,其总贡献率较大,说明在灌浆前期叶绿素含量较高;而在第三次检测中只发现3个QTL,第四次检测中只发现2个QTL,贡献率小于初期的总贡献率,说明随着灌浆进程,叶绿素含量会明显的减少,这与叶片的衰老密切相关。其中Qchl2和Qchl8-1,Qchl8-2,Qchl4-2和Qchl4-1主要是灌浆的前期和中前期对叶绿素含量有着一定作用。Qchl6-1和Qchl6-2两个QTL分别在第三和第四次检测时在剑叶上测到,表明这两个QTL可能与剑叶“持绿”特性或抗衰老关系密切。另外,还检测到36对影响叶绿素含量的双位点互作。只有5对互作位于同一条染色体上,其余互作位于不同染色体上。6对上位性发生在主效和非主效位点之间。没有一对上位性发生在2个主效位点之间。第3染色体上的RM520区域同时与第3和12染色体上的2个位点互作。第1染色体的RM575区域同时与第5和8染色体的2个位点互作。RM85区域在3个时期都检测到。条件QTL共检测到9个发育行为的QTL,分别位于第2、5、6、8和11染色体上。第5染色体的2个等位基因和第11染色体的1个等位基因(RM21)来自TN1,其他6个均来自春江06,能解释总表型变异的26.7%。第6染色体的RM587等位基因,抽穗后,灌浆期的叶绿素含量在t2-t1时期的净表达量增加,所以后期一直表达,在第3、4时期均能检测到。第8染色体的RM310在t3-t2时期的净表达量增加,所以,在后期,不同叶片都能检测到Qchl8的表达。本研究发现的第8染色体的RM1111在灌浆期皆能检测到控制叶绿素含量的QTL,效应明显,有利用价值,是一个侯选基因。由于其加性效应的等位基因来自于CJ06,利用高叶绿素含量的株系DH12、DH46和DH79,与TN1回交,并辅以RM1111和RM310分子标记辅助选择,已获得了BC2F2和NIL-Qchl8。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 一 文献综述
  • 1.1 遗传图谱的构建
  • 1.1.1 遗传图谱构建的意义和进展
  • 1.1.2 遗传图谱构建的主要程序
  • 1.2 分子标记
  • 1.2.1 基于DNA分子杂交技术的DNA标记
  • 1.2.2 基于PCR为基础的分子标记
  • 1.2.3 基于限制酶和PCR相结合的分子标记
  • 1.2.4 基于单个核苷酸多态性的DNA标记-SNP标记
  • 1.3 QTL定位原理与方法及进展
  • 1.3.1 QTL定位原理
  • 1.3.2 QTL定位方法
  • 1.3.3 水稻QTL研究现状及进展
  • 1.4 叶绿素含量的研究进展
  • 二、材料与方法
  • 2.1 供试材料
  • 2.2 田间试验
  • 2.3 叶绿素含量测定
  • 2.4 水稻分子标记连锁图谱的构建
  • 2.5 数据分析和QTL定位
  • 三 结果与分析
  • 3.1 DH群体不同灌浆时期不同叶片的叶绿素含量表型与变异
  • 3.2 QTL分析
  • 3.2.1 主效OTL分析
  • 3.2.2 上位性QTL的定位:
  • 3.2.3 发育行为的QTL定位:
  • 四 结论与讨论
  • 4.1 结论
  • 4.2 讨论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 攻读学位期间发表的学术论文
  • 相关论文文献

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    水稻灌浆期控制叶绿素含量的QTL分析
    下载Doc文档

    猜你喜欢