合欢种子凝集素分离、部分功能鉴定和基因克隆

合欢种子凝集素分离、部分功能鉴定和基因克隆

论文摘要

植物凝集素是一种含有非催化结构域并能可逆结合到特异单糖或寡糖上的植物(糖)蛋白。植物凝集素的诸多功能都与它最重要的性质糖结合专一性有关。由于植物凝集素广泛存在并且种类繁多,加之其特定的作用机理,使得植物凝集素在植物抗病虫基因工程研究中具有较大的应用潜力。本研究以合欢Albizia julibrissin Durazz种子为研究材料,分离了合欢种子凝集素,研究了其理化性质及凝集素对几种真菌孢子萌发和菌丝生长的影响;同时采用RT-PCR和RACE相结合的方法完成了合欢种子凝集素基因的分离克隆。在此基础上利用生物信息学方法对获得的合欢种子凝集素基因进行了结构功能预测分析。通过上述研究得到了以下结果:1.采用硫酸铵沉淀、分子筛层析并结合蛋白超敏可逆染色试剂盒的方法纯化得到了合欢种子凝集素(Albizia julibrissin seed lectin,AJLs),用SDS-PAGE测定其相对分子量为25.4kDa,IEF-PAGE测定其等电点为7.96。蒽酮比色法测定其中性糖含量为2.65%,是一种糖蛋白;凝血活性测定表明,其最低凝集限度为1.95μg/ml,N-乙酰葡糖胺(GlcNAc,N-acetylgucosamine)是合欢种子凝集素的专一性抑制糖。2.对合欢种子凝集素的功能研究表明,凝集素对灰葡萄孢Botrytis cinerea和大丽轮枝菌Verticillium dahliae的孢子萌发具有较强的抑制作用;对细交链孢菌Alternaria alternata菌丝生长有一定的抑制作用,对尖孢镰刀菌Fusariumoxysporum菌丝生长的抑制作用不明显。3.首次克隆得到了合欢凝集素基因的cDNA全长序列。该cDNA全长序列由1096个核苷酸组成,开放阅读框为747个核苷酸,编码248个氨基酸。5’端和3’端各有82和267个核苷酸的非编码区(UTR),3’端有polyA尾。4.利用相关软件及在线生物信息学分析站点对合欢种子凝集素基因编码蛋白的理化性质进行了分析。结果表明,目的蛋白的pI为8.14,预测分子量为26.8kDa。用ClustalX1.83软件进行了同源性比对,并构建了目的蛋白的系统进化树。合欢种子凝集素基因编码蛋白的氨基酸序列与含羞草亚科Mimosoideae球花豆属的Parkia Platycephala氨基酸序列同源性达85%。5.利用在线生物信息学分析服务平台对合欢种子凝集素cDNA基因编码蛋白的结构进行了预测。结果表明,目的蛋白在第12~34位氨基酸之间具有明显的疏水区和跨膜区域。二级结构预测说明目的蛋白的α螺旋的比例在30%以上,β折叠均在20%以下,是一种混合型蛋白。应用同源建模法构建了合欢种子凝集素基因编码蛋白的三级结构,并采用PROCHECK软件对模型的结构质量进行了评价,最优模型为EsyPreD方法构建的模型。6.通过网络服务器平台进行了合欢种子凝集素cDNA基因编码蛋白的功能预测。结果显示,合欢种子凝集素基因编码的蛋白是Glycohydro18 superfamily的新成员,具有Glycohydro18的结构功能域,活性位点位于第146~154之间(序列为LDGVDFDIE),而且有多个磷酸化位点。信号肽区域位于1~27个氨基酸,即MGTKLRNPKIILVLQVCLIMMVSTAKA。跨膜片段位于第12~34位氨基酸残基。亚细胞定位分析表明目的蛋白是一种分泌性蛋白(胞外蛋白)。本论文对合欢种子凝集素的研究填补了我国在含羞草亚科植物凝集素方面的研究空白,并为今后开展木本植物凝集素基因的在抗病虫研究方面的应用奠定了一定的理论基础,具有一定的的理论价值和现实意义。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 1 引言
  • 1.1 植物凝集素的研究进展
  • 1.1.1 凝集素的发现及定义
  • 1.1.2 凝集素的分布
  • 1.1.3 植物凝集素的命名与分类
  • 1.1.4 植物凝集素的性质
  • 1.1.5 凝集素的功能
  • 1.1.6 植物凝集素的分离及基因的克隆
  • 1.2 植物凝集素在抗病虫植物基因工程中的研究概况
  • 1.3 凝集素在植物抗病性方面的研究与应用
  • 1.4 本论文的立体依据和技术路线
  • 1.4.1 立项依据与研究意义
  • 1.4.2 研究的技术路线
  • 2 合欢种子凝集素的分离及部分性质研究
  • 2.1 材料
  • 2.1.1 植物材料
  • 2.1.2 试剂与仪器设备
  • 2.2 研究方法
  • 2.2.1 合欢种子凝集素蛋白粗提物的制备
  • 2.2.2 合欢凝集素(AJLs)的纯化
  • 2.2.3 合欢种子凝集素性质的测定
  • 2.2.4 N-末端氨基酸序列测定
  • 2.3 结果与分析
  • 2.3.1 合欢种子凝集素(AJLs)的分离纯化
  • 2.3.2 合欢种子凝集素(AJLs)的性质测定
  • 2.3.3 合欢种子凝集素(AJLs)N-端氨基酸的测定
  • 2.4 讨论
  • 2.4.1 合欢种子凝集素蛋白的分离方法的选择
  • 2.4.2 关于合欢种子凝集素
  • 2.4.3 合欢种子凝集素(AJLs)N-端氨基酸的测定
  • 2.5 小结
  • 3 合欢种子凝集素的对真菌生长的影响
  • 3.1 材料
  • 3.1.1 试验用菌种
  • 3.1.2 合欢种子凝集素
  • 3.1.3 培养基
  • 3.2 研究方法
  • 3.2.1 试验菌种的培养
  • 3.2.2 不同浓度合欢种子凝集素的配制
  • 3.2.3 接种方法
  • 3.3 结果与分析
  • 3.3.1 合欢种子凝集素对真菌孢子萌发的影响
  • 3.3.2 合欢种子凝集素对真菌对菌丝生长的抑制
  • 3.4 讨论
  • 3.5 小结
  • 4 合欢种子凝集素的基因克隆及序列分析
  • 4.1
  • 4.1.1 试验材料
  • 4.1.2 试剂和仪器设备
  • 4.2 研究方法
  • 4.2.1 合欢总RNA提取和质量检测
  • 4.2.2 合欢种子凝集素基因片段的RT-PCR扩增、克隆和鉴定
  • 4.2.3 合欢种子凝集素基因全长cDNA的获得
  • 4.3 结果与分析
  • 4.3.1 DNA/RNA的质量分析
  • 4.3.2 合欢凝集素基因片段克隆、鉴定和序列分析
  • 4.3.3 合欢种子凝集素基因全长cDNA的克隆、鉴定及分析
  • 4.4 讨论
  • 4.4.1 关于合欢总RNA的提取
  • 4.4.2 关于合欢种子凝集素基因的cDNA全长序列的获得方法
  • 4.4.3 关于合欢种子凝集素基因cDNA及其编码蛋白的Blast分析
  • 4.5 小结
  • 5 合欢种子凝集素基因编码蛋白的结构和功能预测
  • 5.1 材料和方法
  • 5.1.1 合欢种子凝集素cDNA编码蛋白的结构分析
  • 5.1.2 合欢凝集素基因编码蛋白的功能预测
  • 5.2 结果与分析
  • 5.2.1 合欢凝集素基因编码蛋白的结构分析
  • 5.2.2 合欢凝集素基因编码蛋白的功能预测
  • 5.3 讨论
  • 5.3.1 氨基酸结构预测分析
  • 5.3.2 功能预测
  • 5.3.3 合欢凝集素基因编码蛋白系统进化树分析
  • hydro18 superfamily'>5.3.4 关于Glycohydro18 superfamily
  • 5.4 小结
  • 6 结论及研究展望
  • 6.1 结论
  • 6.2 研究展望
  • 主要参考文献
  • 附录1 正文中应用的缓冲液和培养基的配制
  • 附录2 论文缩略词表
  • 附图
  • 1.凝血活性测定图
  • 2.AJLS对灰葡萄孢BOTRYTIS CINEREA孢子萌发的影响
  • 3.AJLS对尖孢镰刀菌F.OXYSPORUM菌丝生长影响菌丝生长的影响
  • 作者简介
  • 导师简介
  • 在读期间获得的成果及论著目录
  • 致谢
  • 相关论文文献

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