本文主要研究内容
作者万思瑶（2019）在《stat1b基因突变对斑马鱼胚胎早期发育转录组调控的研究》一文中研究指出：信号转导与转录激活因子（STAT1）与多种细胞因子和生长因子的信号转导相关联,同时参与多种细胞功能的调节,例如参与调节免疫系统,抑制肿瘤细胞的增长,抑制细胞分化,促进细胞的凋亡。本实验室在前期分析了人类STAT1基因在低骨密度（BMD）中高表达,以及在stat1b突变品系斑马鱼中破骨细胞（OC）含量增加。斑马鱼与人类在遗传上和生理上都具有比较高的同源性,并且斑马鱼具有较强的基因编辑能力、世代时间较短和发育阶段比较快速等等特点,使得斑马鱼常被选定为研究对象。本研究运用高通量测序获得了有关于stat1b基因纯系突变品系和野生型斑马鱼的大量转录组数据,有助于人类从分子水平上对stat1b基因进行深入研究。本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术对斑马鱼stat1b基因进行了敲除。通过一系列实验,包括DNA基因组提取、目的片段的扩增、DNA纯化回收、T7核酸内切酶Ⅰ酶切、TA克隆和Sanger测序鉴定stat1b突变型斑马鱼并且成功获得了stat1b F3代纯合突变品系斑马鱼,建立了stat1b-/-突变模型。本文通过Illumina HiSeq平台分别对stat1b-S2基因纯合突变体和野生型斑马鱼的胚胎的1-细胞时期、2-细胞时期、4-细胞时期、8-细胞时期、16-细胞时期这五个细胞时期进行高通量测序,使用GO富集和KEGG通路来分析每个发育阶段胚胎的差异基因。结果显示,在stat1b纯合突变品系与野生型斑马鱼的胚胎的比较组合中,1-细胞时期、2-细胞时期、4-细胞时期、8-细胞时期、16-细胞时期分别筛选出4791、3623、4319、7648、7889个差异基因。突变体与野生型斑马鱼胚胎五个细胞时期的相互比较样品的前50个差异表达显著的基因中,fl1a基因表达为上调,adcy8基因和me3基因表达为下调。GO富集分析显示,在五个细胞时期的差异基因主要富集在代谢过程、细胞内组分等方面;KEGG通路富集分析结果表明,在五个细胞时期的差异基因主要与RNA转运、泛素介导的蛋白水解、蛋白质在内质网上的加工等通路相关联。根据结果数据分析,stat1b基因敲除后,使得斑马鱼胚胎早期发育过程中,eif4e2、eif3jb、senp2基因的表达下调,从而影响RNA转运通路。此外,分别对stat1b纯合突变品系和野生型斑马鱼每个细胞时期的比较组合的差异基因进行了初步的筛选,发现其大部分的差异基因与锌指蛋白相关,推测stat1b基因可能与细胞分化相关,从分子水平上揭示了stat1b基因突变伴随的相关生物学功能和通路所发生的变化。
Abstract
xin hao zhuai dao yu zhuai lu ji huo yin zi （STAT1）yu duo chong xi bao yin zi he sheng chang yin zi de xin hao zhuai dao xiang guan lian ,tong shi can yu duo chong xi bao gong neng de diao jie ,li ru can yu diao jie mian yi ji tong ,yi zhi zhong liu xi bao de zeng chang ,yi zhi xi bao fen hua ,cu jin xi bao de diao wang 。ben shi yan shi zai qian ji fen xi le ren lei STAT1ji yin zai di gu mi du （BMD）zhong gao biao da ,yi ji zai stat1btu bian pin ji ban ma yu zhong po gu xi bao （OC）han liang zeng jia 。ban ma yu yu ren lei zai wei chuan shang he sheng li shang dou ju you bi jiao gao de tong yuan xing ,bing ju ban ma yu ju you jiao jiang de ji yin bian ji neng li 、shi dai shi jian jiao duan he fa yo jie duan bi jiao kuai su deng deng te dian ,shi de ban ma yu chang bei shua ding wei yan jiu dui xiang 。ben yan jiu yun yong gao tong liang ce xu huo de le you guan yu stat1bji yin chun ji tu bian pin ji he ye sheng xing ban ma yu de da liang zhuai lu zu shu ju ,you zhu yu ren lei cong fen zi shui ping shang dui stat1bji yin jin hang shen ru yan jiu 。ben yan jiu li yong CRISPR/Cas9ji yin bian ji ji shu dui ban ma yu stat1bji yin jin hang le qiao chu 。tong guo yi ji lie shi yan ,bao gua DNAji yin zu di qu 、mu de pian duan de kuo zeng 、DNAchun hua hui shou 、T7he suan nei qie mei Ⅰmei qie 、TAke long he Sangerce xu jian ding stat1btu bian xing ban ma yu bing ju cheng gong huo de le stat1b F3dai chun ge tu bian pin ji ban ma yu ,jian li le stat1b-/-tu bian mo xing 。ben wen tong guo Illumina HiSeqping tai fen bie dui stat1b-S2ji yin chun ge tu bian ti he ye sheng xing ban ma yu de pei tai de 1-xi bao shi ji 、2-xi bao shi ji 、4-xi bao shi ji 、8-xi bao shi ji 、16-xi bao shi ji zhe wu ge xi bao shi ji jin hang gao tong liang ce xu ,shi yong GOfu ji he KEGGtong lu lai fen xi mei ge fa yo jie duan pei tai de cha yi ji yin 。jie guo xian shi ,zai stat1bchun ge tu bian pin ji yu ye sheng xing ban ma yu de pei tai de bi jiao zu ge zhong ,1-xi bao shi ji 、2-xi bao shi ji 、4-xi bao shi ji 、8-xi bao shi ji 、16-xi bao shi ji fen bie shai shua chu 4791、3623、4319、7648、7889ge cha yi ji yin 。tu bian ti yu ye sheng xing ban ma yu pei tai wu ge xi bao shi ji de xiang hu bi jiao yang pin de qian 50ge cha yi biao da xian zhe de ji yin zhong ,fl1aji yin biao da wei shang diao ,adcy8ji yin he me3ji yin biao da wei xia diao 。GOfu ji fen xi xian shi ,zai wu ge xi bao shi ji de cha yi ji yin zhu yao fu ji zai dai xie guo cheng 、xi bao nei zu fen deng fang mian ;KEGGtong lu fu ji fen xi jie guo biao ming ,zai wu ge xi bao shi ji de cha yi ji yin zhu yao yu RNAzhuai yun 、fan su jie dao de dan bai shui jie 、dan bai zhi zai nei zhi wang shang de jia gong deng tong lu xiang guan lian 。gen ju jie guo shu ju fen xi ,stat1bji yin qiao chu hou ,shi de ban ma yu pei tai zao ji fa yo guo cheng zhong ,eif4e2、eif3jb、senp2ji yin de biao da xia diao ,cong er ying xiang RNAzhuai yun tong lu 。ci wai ,fen bie dui stat1bchun ge tu bian pin ji he ye sheng xing ban ma yu mei ge xi bao shi ji de bi jiao zu ge de cha yi ji yin jin hang le chu bu de shai shua ,fa xian ji da bu fen de cha yi ji yin yu xin zhi dan bai xiang guan ,tui ce stat1bji yin ke neng yu xi bao fen hua xiang guan ,cong fen zi shui ping shang jie shi le stat1bji yin tu bian ban sui de xiang guan sheng wu xue gong neng he tong lu suo fa sheng de bian hua 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自湖南师范大学的万思瑶，发表于刊物湖南师范大学2019-10-31论文，是一篇关于斑马鱼论文,高通量测序论文,湖南师范大学2019-10-31论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自湖南师范大学2019-10-31论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：斑马鱼论文; 高通量测序论文; 湖南师范大学2019-10-31论文;