小口白甲鱼核型及mtDNA多样性研究

论文摘要

小口白甲鱼（Onychostoma lini）属于鲤形目（Cypriniformes）鲤科（Cyprinidae）鲃亚科（Barbinae）白甲鱼属（Onychostoma）,主要分布于沅江水系、珠江水系、汀江和九龙江等水系。多年来,其种群数量日趋减少,种质资源正濒临消失的危险,现已被列为易危鱼类。小口白甲鱼在贵州主要分布在隶属于沅江水系的清水江和隶属于珠江水系的都柳江,是当地的名贵经济鱼类。到目前为止,有关小口白甲鱼的研究资料仅限于其形态、分类、分布等方面,其他研究尚未见报道。本文以小口白甲鱼为材料,对其染色体核型和线粒体DNAD-loop区序列分析进行研究。主要结果如下:通过对小口白甲鱼进行核型分析,发现小口白甲鱼核型公式为2n=50,12m+8sm+4st+26t,染色体臂数为NF=70,未发现异型染色体、随体染色体和次缢痕。通过计算染色体的相对长度,发现小口白甲鱼的染色体相对长度在6.429±0.39与2.320±0.06之间,两相邻的染色体的相对长度差异不大。比较了小口白甲鱼的核型与其它白甲鱼类核型,发现它们的二倍染色体数（2n）均为50,小口白甲鱼的进化程度最低,是原始类型。在对小口白甲鱼进行资源保护时要加强遗传多样性的保护。采用PCR结合DNA测序技术测定分析了小口白甲鱼36尾个体mtDNAD环约470bp序列的变异及遗传多样性。结果表明,在36尾个体中,该序列的长度存在变异,变化幅度为469bp～475bp。该序列的碱基组成为A+T含量（68.4%）高于G+C含量（31.6%）。共检测到25个变异位点,其中转换19个,颠换6个。核苷酸多样性（π）为0.00575,平均核苷酸差异数（K）为2.695。36尾个体分属5个单倍型,单倍型间的平均遗传距离（P）为0.026。5个单倍型构建的UPGMA系统树和NJ系统树形成2个分支。目前小口白甲鱼mtDNAD环序列存在着较丰富的多样性。

论文目录

• 致谢
• 目录
• 图
• 表
• 部分缩写中英文对照
• 摘要
• Abstract
• 1 文献综述
• 1.1 鱼类核型研究概况
• 1.1.1 鱼类核型研究种类
• 1.1.2 鱼类核型研究方法
• 1.1.3 染色体在遗传学和分类学中的作用
• 1.2 鱼类遗传多样性的研究
• 1.2.1 鱼类的染色体遗传多样性
• 1.2.2 鱼类的蛋白质遗传多样性
• 1.2.3 鱼类的DNA遗传多样性
• 1.2.4 鱼类mtDNA研究现状
• 1.3 小口白甲鱼研究概况
• 1.3.1 白甲鱼属鱼类研究概况
• 1.3.2 小口白甲鱼研究现状
• 1.4 本研究目的及意义
• 2 材料与方法
• 2.1 材料来源
• 2.2 样品的采集和处理
• 2.3 试验试剂
• 2.3.1 核型分析试剂及试剂配制
• 2.3.2 mtDNA多样性分析试剂、试剂盒及试剂配制
• 2.4 实验仪器
• 2.4.1 核型分析所需仪器
• 2.4.2 mtDNA多样性分析所需仪器
• 2.5 实验方法
• 2.5.1 核型实验方法
• 2.5.2 mtDNA多样性分析实验方法
• 2.6 分析方法
• 2.6.1 核型分析方法
• 2.6.2 mtDNA多样性分析方法
• 3 结果
• 3.1 核型结果
• 3.1.1 小口白甲鱼染色体数目
• 3.1.2 小口白甲鱼染色体的相对长度和臂比指数
• 3.1.3 小口白甲鱼核型
• 3.2 mtDNA多样性分析结果
• 3.2.1 小口白甲鱼总 DNA提取结果
• 3.2.2 小口白甲鱼mtDNA D-loop区的PCR扩增产物
• 3.2.3 小口白甲鱼mtDNA D-loop区核苷酸碱基组成
• 3.2.4 小口白甲鱼不同个体中变异位点的分布
• 3.2.5 小口白甲鱼mtDNAD-loop控制区基因单倍型分析
• 3.2.6 小口白甲鱼种群内遗传多样性
• 3.2.7 小口白甲鱼个体间的遗传关系
• 3.2.8 单倍型系统发育系统树的构建
• 4 讨论
• 4.1 小口白甲鱼核型
• 4.1.1 小口白甲鱼核型的特征
• 4.1.2 小口白甲鱼核型与系统演化的关系
• 4.1.3 小口白甲鱼核型与育种
• 4.1.4 实验过程中影响试验结果的原因分析
• 4.2 mtDNA多样性分析讨论
• 4.2.1 小口白甲鱼mtDNA D-loop区长度变异分析
• 4.2.2 小口白甲鱼mtDNA D-loop区核酸组成与多态性分析
• 4.2.3 小口白甲鱼遗传多样性分析
• 4.2.4 小口白甲鱼遗传多样性的保护
• 5 结论
• 参考文献
• 附录