蓝果忍冬（LONICERAL.SUBSECT.CAERULEAE）SRAP反应体系的建立及遗传多样性分析

论文摘要

蓝果忍冬（Lonicera Caerulea L.）属忍冬科（caprifoliaceae）、忍冬属（Lonicera L.）,多年生落叶小灌木,具有良好的环境适应性,主要分布在俄罗斯、日本、朝鲜和北美,中国的大小兴安岭、长白山等地也蕴含着丰富的野生资源;果实蓝紫色,由其加工成的果酱、饮料、罐头、果酒等无公害食品,既含有花青素、矿物质和维生素等生物活性物质,又具有很好的药用保健价值,深受世界各地人们的喜爱,是第三代果树之一,可与蓝莓相媲美,市场前景看好。本实验于2009年～2010年在东北农业大学园艺学院进行,以我国第一个蓝果忍冬种质资源圃中的58份蓝果忍冬资源为试材,确立了蓝果忍冬叶片基因组DNA的最佳提取方法,讨论了SRAP-PCR反应体系中各因素对扩增结果的影响并对反应体系进行了优化,对58份蓝果忍冬的遗传多样性进行了分析,目的是为了解蓝果忍冬居群的遗传多样性水平和资源的保护与开发利用提供理论依据。主要结果如下:1、DNA的分离提取是进行基因组多样性分析的基础,是分子生物学研究中重要的基本技术。不同的植物材料因其组织细胞中所含此生代谢产物的种类、含量不同,提取方法也不同。蓝果忍冬叶片富含多糖、多酚等次生代谢产物,这些物质会影响叶片基因组DNA提取的质量,本实验对常规CTAB法和改良CTAB法进行了比较,结果表明改良CTAB法提取出的DNA条带明亮,没有拖尾现象,适于蓝果忍冬基因组DNA的提取。改良CTAB法即在液氮研磨过程中加入PVP粉末,防止酚类物质氧化,用SET核分离缓冲液对样品进行预洗,将细胞核与多糖和多酚等次生物质分开,提取效果较好,OD260/OD280保持在1.7～1.9之间,能够满足SRAP扩增的要求。2、PCR反应体系中各反应因素的用量对PCR反应的结果具有很大影响,本实验对反应体系中Tag DNA聚合酶、模板DNA、dNTPs、Mg2+和引物进行单因素实验,建立了蓝果忍冬SRAP-PCR的最佳反应体系（20μl）为:2.0μl 10×PCR buffer、1.0U Tag DNA聚合酶、20ng模板DNA、0.20mmol/l dNTPs、2.0mmol/lMg2+、0.3μmol/l引物。反应程序为:94℃预变性5min;94℃变性1min,35℃复性1min,72℃延伸90s,5个循环;94℃变性1min,50℃复性1min,72℃延伸90s,35个循环;72℃延伸8min。4℃保存。3、在引物筛选过程中,以贝瑞尔、库页岛、大兴安岭野生资源为材料,从90个引物组合中筛选出20个多态性高、扩增条带清晰稳定的引物组合。利用所筛选的引物对58份材料进行扩增,共扩增出172个条带,其中多态性条带143个,占总条带的83.1%,其中每对引物扩增出5-12个条带。品种间遗传相似系数在0.53-0.96之间。4、利用筛选出的引物和优化后的体系对参试品种进行PCR扩增,电泳条带按1/0形式进行数据转换,选择清晰、再现性强的谱带作为统计对象记为l,无扩增谱带记为0,UPGMA法聚类构建树状图并进行遗传多样性分析。58份资源被聚为7类,来自俄罗斯地区的资源聚为一类,伊春、尚志、勃利的资源聚在一起,新疆阿尔泰、大兴安岭野生和长白山野生资源分别单独聚类,各成一组,贝瑞尔、蓝鸟、蓝纺锤三个栽培品种和E3、E6、VIR聚在一起,杂交苗聚在一起成为一类。23号未知资源与海参崴资源聚在一起,说明23号可能是来自海参崴地区资源或是其杂交后代。其中来自东北地区的资源分成了四个组群,由此可知,东北地区的蓝果忍冬具有较高的遗传变异,同时也说明了东北地区是蓝果忍冬遗传多样性中心之一。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 引言
• 1.1 蓝果忍冬概况
• 1.1.1 蓝果忍冬的营养价值
• 1.1.2 蓝果忍冬的药用保健价值
• 1.1.3 蓝果忍冬的起源和分类
• 1.1.4 蓝果忍冬的遗传多样性
• 1.1.5 蓝果忍冬的开发利用前景
• 1.2 遗传多样性研究
• 1.2.1 遗传多样性概述
• 1.2.2 遗传多样性研究方法
• 1.3 常见分子标记及其在果树中的应用
• 1.3.1 RFLP 标记
• 1.3.2 RAPD 标记
• 1.3.3 SSR 标记
• 1.3.4 ISSR 标记
• 1.3.5 AFLP 标记
• 1.3.6 其它分子标记技术
• 1.4 SRAP 标记及其在植物上的应用
• 1.4.1 SRAP 的概念和原理
• 1.4.2 SRAP 技术的特点
• 1.4.3 SRAP 的应用
• 1.5 本研究的目的与意义
• 2 材料与方法
• 2.1 材料与仪器
• 2.1.1 试验材料
• 2.1.2 试验试剂
• 2.1.3 试验仪器
• 2.2 试验方法
• 2.2.1 DNA 的提取
• 2.2.2 DNA 样品检测
• 2.2.3 SRAP-PCR 反应体系的优化
• 2.2.4 引物筛选
• 2.2.5 SRAP-PCR 扩增与电泳检测
• 2.2.6 数据统计分析
• 3 结果与分析
• 3.1 蓝果忍冬DNA 的提取
• 3.2 SRAP-PCR 反应体系优化
• 3.2.1 dNTPs 浓度对SRAP 扩增的影响
• 2+浓度对SRAP 扩增的影响'>3.2.2 Mg²⁺浓度对SRAP 扩增的影响
• 3.2.3 Tag DNA 聚合酶对SRAP 扩增的影响
• 3.2.4 引物浓度对SRAP 扩增的影响
• 3.2.5 DNA 模板浓度对SRAP 扩增的影响
• 3.2.6 蓝果忍冬SRAP 反应体系稳定性检测
• 3.3 SRAP 引物的筛选
• 3.4 SRAP 扩增的多态性分析
• 3.5 58 份蓝果忍冬资源的聚类分析
• 3.6 58 份蓝果忍冬资源的主坐标分析
• 4 讨论
• 4.1 忍冬科植物DNA 提取方法
• 4.2 蓝果忍冬SRAP 反应体系的建立
• 4.3 SRAP 分子标记在蓝果忍冬亲缘关系研究中的可靠性
• 4.4 蓝果忍冬遗传多样性
• 5 结论
• 致谢
• 参考文献
• 附录
• 攻读硕士学位期间发表的学术论文