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不同种群獐的遗传多样性及保护对策研究

2020-11-23阅读(331)

不同种群獐的遗传多样性及保护对策研究

论文摘要

獐，别名河麂、牙獐，属于鹿科，偶蹄目，共记录2个亚种：Hydropotes inermis inermis Swinhoe，1870，和Hydropotes inermis argyropus Heude，1884。亚种Hydropotes inermis inermis曾广布于我国辽东半岛，华北平原及长江两岸，既北纬28°至42°之间，东经110°以东范围内，现在的分布范围处于北纬24°-34°及东经110°以东范围内；另一亚种Hydropotes inermis argyropus在朝鲜半岛有自然种群的分布，主要分布在北纬43°以南地区。20世纪初獐被引种到英国，有报道獐也被引入了法国。近年来我国野生獐的数量急剧下降，分布地区也急剧缩小，獐在许多分布区内已经绝迹或很罕见。獐已被列为我国国家二级保护动物，IUCN红皮书将其列为低危／接近受危（LR／nt）。因此，有必要对獐的分布与生境变迁、现存的主要种群遗传结构与致危因素进行分析，提出科学可行的保护策略。 本研究用非伤害性和非损伤性的取样方法采集了我国浙江省、江苏省、江西省和韩国境内分布的獐肌肉、皮张、血液、毛发、粪便、骨骼等样本，实验测得獐细胞色素b、控制区、12SrRNA三个基因及基因间tRNA，序列总长2761-2764bp，以及一个林麝样本的细胞色素b全序列和12SrRNA487bp序列。另外，筛选了11个引物对舟山和盐城的样本进行了RAPD实验比较遗传多样性。同时，通过文献、考古考证调查獐的分布变化和原因，并考察獐在现主要分布地所面临的威胁，对獐的偷猎和重引入进行了问卷调查，结合保护遗传学的研究结果提出保护策略。研究结果与建议如下： 1．实验得到线粒体DNA细胞色素b全序列36个样本，有21个单倍型；得到线粒体DNA控制区全序列27个样本，全长926-929bp，与Pro-tRNA基因相邻前端片段6个样本，采用与Pro-tRNA基因相邻的高变区400bp进行分析，共有27个单倍型；得到线粒体12SrRNA 487bp序列34个样本，共有12个单倍型。獐的细胞色素b的平均差异为：1.40％，控制区高变区的平均差异为：2.13％，12SrRNA序列的平均差异为1.02％。獐的细胞色素b、控制区高变区和12SrRNA的核苷酸多样性分别为0.01339±0.02920，0.0174±0.0023和0.00804±0.0010，与其他珍稀鹿类动物相比，獐的遗传多样性程度较高。 2．从线粒体DNA细胞色素b、控制区高变区和12SrRNA片断平均核苷酸差异（K）、核苷酸多样性（π）和双参数遗传距离的比较得出：盐城的遗传多样性最高，其次是吉山种群，舟山种群的遗传多样性最低。RAPD的实验结果也表明盐城

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstract
  • 目录
  • 引言
  • 第一章 研究综述
  • 1 獐的简述
  • 1.1 獐的生物学特征
  • 1.2 獐的分类
  • 1.3 獐对于人类的价值
  • 1.4 獐的濒危状况
  • 1.5 獐的保护现状
  • 2 保护遗传学简述
  • 2.1 保护生物学与保护遗传学的产生
  • 2.2 保护遗传学研究方法
  • 2.3 线粒体DNA在保护遗传学研究中的应用
  • 3 野生动物DNA研究取样方法简述
  • 4 制定保护策略前需要了解的问题
  • 第二章 研究方法
  • 1 保护遗传学的研究方法
  • 1.1 样本来源与保存
  • 1.2 DNA的提取
  • 1.3 RAPD实验
  • 1.4 线粒体DNA实验
  • 1.5 数据分析方法
  • 2 有关獐的调查方法
  • 第三章 獐的分布变迁及原因分析
  • 1 古代獐的变迁
  • 1.1 獐化石及残骸的考古发现
  • 1.2 獐的古代生存环境变化
  • 2 獐的分布现状及原因
  • 2.1 獐在我国的分布现状
  • 2.2 獐数量下降的原因分析
  • 2.3 圈养獐的状况
  • 第四章 保护遗传学的研究结果及讨论
  • 1 RAPD实验结果
  • 2 线粒体DNA实验结果
  • 2.1 线粒体DNA细胞色素b序列结果
  • 2.2 线粒体DNA控制区序列结果
  • 2.3 线粒体12SrRNA序列结果
  • 2.4 线粒体DNA2761-2764bp序列系统树
  • 3 实验结果的分析与讨论
  • 3.1 遗传多样性程度
  • 3.2 系统发育与分类
  • 3.3 獐的亚种分类
  • 3.4 我国种群间遗传关系
  • 3.5 种群历史动态
  • 3.6 进化显著单元与管理单元
  • 4 实验技术讨论
  • 4.1 DNA提取技术讨论
  • 4.2 PCR条件优化及影响因素分析
  • 4.3 测序反应影响因素分析
  • 第五章 獐的保护对策分析
  • 1 就地保护
  • 1.1 舟山群岛
  • 1.2 盐城沿海地区
  • 1.3 鄱阳湖地区
  • 1.4 其它地区
  • 2 迁地保护——獐的重引入可行性分析
  • 2.1 獐的遗传背景的分析
  • 2.2 獐的区域灭绝和种群数量下降原因分析
  • 2.3 獐的生存条件分析
  • 2.4 重引入经验借鉴
  • 2.5 释放个体选择
  • 2.6 重引入地点的选择
  • 2.7 社会经济和法律保障
  • 3 上海作为重引入地的建议
  • 3.1 上海的自然概况
  • 3.2 獐在上海的分布历史
  • 3.3 适宜的种源
  • 3.4 上海的社会经济状况
  • 3.5 上海市民对獐重引入的态度
  • 3.6 讨论
  • 4 圈养獐的福利问题
  • 第六章 结论与展望
  • 1 结论
  • 2 展望
  • 参考文献
  • 附录
  • 附图
  • 致谢

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