肺癌骨转移相关分子的比较蛋白质组学研究

肺癌骨转移相关分子的比较蛋白质组学研究

论文摘要

背景:肺癌转移是肺癌的恶性标志和特征,也是肺癌病人治疗失败和死亡的主要原因。骨是肺癌转移最常见的靶器官之一。深入研究肿瘤骨转移的分子和细胞学机制,可以更好的指导肺癌骨转移相关疾病的临床诊断和治疗。肺癌骨转移是一个多步骤、多阶段、多因素和多基因调控的复杂过程,传统的单基因研究模式限制了肺癌骨转移相关因素的研究发展。比较蛋白质组学作为多基因、多因素复杂病理机制研究的有效手段,可高通量、大规模地筛检在疾病发生发展中起重要作用的关键蛋白质分子,运用该研究策略,可获得一些传统手段无法得到的新蛋白标志物、新关键分子,极大地丰富诊断标志物的选择组合及复杂致病机理的全面阐明。目的:本研究以人肺癌骨转移细胞系SBC-5和非骨转移细胞系SBC-3/DOX为研究对象,采用双向凝胶电泳技术分离细胞可溶性总蛋白,建立不同细胞系的蛋白质表达谱,并分析比较,发现差异表达蛋白质,然后对这些蛋白质进行质谱分析和生物信息学鉴定,为筛选逆转或控制肺癌骨转移的分子靶点提供实验依据。方法:分别提取人肺癌细胞系SBC-5和SBC-3/DOX细胞总蛋白,通过双向凝胶电泳分离,第一向采取固相pH梯度等电聚焦电泳,第二向采用SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,最后进行硝酸银染色。通过双向电泳图像分析软件PDQuest 8.0对2-DE图谱进行数字化分析匹配与对比,寻找差异表达蛋白质点。采用基质辅助激光解析电离飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)技术对差异蛋白进行肽质量指纹图谱解析,获取差异蛋白点肽指纹图谱(PMF)。应用生物信息学的方法进行数据库搜索,初步鉴定差异蛋白质,并对蛋白质的功能进行初步分析。结果:PDQuest 8.0软件分析3次相同条件下的2-DE图谱,结果显示重复性、匹配性较好。SBC-5检测到(1116±64)个蛋白点,平均匹配率为84%;SBC-3/DOX检测到(1132±72)个蛋白点,平均匹配率为82%;蛋白质点分布以PI 4~7、相对分子质量20 000~80 000范围内最多。两种细胞株16个差异蛋白质点胰酶胶内酶解,质谱分析获得14张肽质量指纹谱,鉴定出Annexin A1、CaN、IGFBP-1、ADAM 32等8种差异表达蛋白质。结论:本研究获得了重复性和分辨率较好的人肺癌细胞系SBC-5和SBC-3/DOX的双向凝胶电泳图谱。骨转移能力不同的两株细胞间蛋白质组存在着显著差异,质谱分析鉴定出了8种差异表达蛋白质。这些蛋白与肿瘤细胞的生长、增殖、分化、转移、信号传导调控等过程有关,为进一步筛选用于肺癌骨转移诊断、治疗、预后评估的分子标志物奠定了坚实的基础。

论文目录

  • 缩略语表
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 前言
  • 文献回顾
  • 正文 实验
  • 1 材料
  • 2 方法
  • 3 结果
  • 4 讨论
  • 小结
  • 参考文献
  • 附录
  • 个人简历和研究成果
  • 致谢
  • 相关论文文献

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