广西普通野生稻（Oryza rufipogon Griff.）遗传多样性核心种质构建的研究

论文摘要

普通野生稻是栽培稻的祖先,是水稻育种的重要遗传资源。而广西是我国普通野生稻主要分布地,在我国稻种资源中有着独特的地位。当前,广西普通野生稻分布点环境破坏严重,分布面积逐渐萎缩,正处于濒危状态,妥善保护好野生稻资源是广西野生稻资源研究的首要问题。本文应用SSR标记研究广西普通野生稻9个居群的遗传多样性,构建其核心种质,旨在为广西普通野生稻保护提供理论依据。研究结果为:广西普通野生稻具有丰富的遗传多样性:24个SSR位点总共检测到114个等位变异,平均每个位点检测到4.75个等位变异,平均等位变异数(A)为4.75、平均Shannon信息指数(Ⅰ)为1.1801、遗传多样性指数(He)为0.6388。9个普通野生稻居群的遗传多样性指数大小顺序为:邕宁居群(YN)＞临桂居群(LG)＞扶绥居群(FS)＞容县居群(RX)＞贵港居群(GG)＞平南居群(PN)＞古棚居群(GP)＞五里塘居群(WL)＞博白居群(BB);9个居群的平均遗传多样性指数(He)为0.4916,其中有5个居群在平均值以上:YN、LG、FS、RX、GG。广西普通野生稻构建核心种质研究表明,5%的核心样本代表89%广西普通野生稻居群的遗传多样性,20%的核心样本可以代表94%的遗传多样性。5%的核心样本的遗传参数为:等位基因数(A)为4.2500,有效等位基因数(Ae)为3.0638,Shannon信息指数(Ⅰ)为1.2012,遗传多样性指数(He)为0.6605,表明其基本上包括了居群的遗传多样性,而20%的核心样本能更好代表全部材料的遗传多样性。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 前言
• 1.1 野生稻的概述
• 1.1.1 中国野生稻的分类
• 1.1.2 野生稻的地理分布
• 1.1.3 普通野生稻的形态学、生物学和生态学特征
• 1.2 遗传多样性的研究
• 1.2.1 遗传多样性研究的意义
• 1.2.2 遗传多样性的研究方法
• 1.3 野生稻的遗传多样性研究和在育种中的应用价值
• 1.3.1 野生稻的遗传多样性研究
• 1.3.2 野生稻在育种中的应用价值
• 1.4 植物核心种质构建的研究
• 1.4.1 核心种质的概念、特点和意义
• 1.4.2 核心种质构建的步骤及方法
• 1.4.3 核心种质的评价和检验
• 1.5 我国野生稻濒危状况和保护现状
• 1.5.1 我国野生稻的濒危状况
• 1.5.2 保护生物学研究
• 1.6 研究的意义和目的
• 2 材料与方法
• 2.1 供试材料
• 2.1.1 广西普通野生稻
• 2.1.2 栽培稻品种
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 主要仪器设备及及主要试剂的配制
• 2.2.2 DNA的提取及检测
• 2.2.3 SSR引物来源
• 2.2.4 PCR扩增及扩增结果的检测
• 2.3 数据统计分析
• 2.3.1 数据统计
• 2.3.2 遗传多样性数据分析
• 2.3.3 聚类分析
• 3 结果分析
• 3.1 普通野生稻SSR遗传多样性
• 3.2 普通野生稻居群间遗传多样性
• 3.2.1 普通野生稻居群间遗传多样性分析
• 3.2.2 普通野生稻Nei遗传距离和遗传一致度
• 3.2.3 普通野生稻居群间的聚类分析
• 3.3 普通野生稻与栽培稻遗传多样性比较分析
• 3.4 普通野生稻遗传多样性核心种质构建研究
• 3.4.1 核心种质构建的方法
• 3.4.2 核心种质构建的结果分析
• 4 讨论
• 4.1 普通野生稻SSR遗传多样性
• 4.2 SSR引物的选择和数量的关系
• 4.3 广西普通野生稻的遗传多样性
• 4.4 广西普通野生稻与栽培稻遗传多样性比较
• 4.5 广西普通野生稻核心种质的遗传特性
• 4.6 广西普通野生稻核心种质的代表性
• 4.7 广西普通野生稻保护策略探讨
• 5 结论
• 致谢
• 参考文献
• 附录A
• 附录B