油菜雄性不育相关基因的表达差异及克隆与序列分析

油菜雄性不育相关基因的表达差异及克隆与序列分析

论文摘要

油菜是我国重要的油料作物,在我国的油料生产和食用油供给中占有极其重要的地位。油菜也是杂种优势利用普遍的一种作物,其雄性不育的分子机理及其应用基础的研究深受人们重视。本文基于甘蓝型油菜双显性雄性核不育近等基因系材料的芯片表达谱分析结果,分别选择了与糖代谢途径相关的两个基因GAPC(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, cytosolic)和AT2G36580 ;与脂肪酸代谢途径相关的两个基因LACS9(long-chain acyl-CoA synthetase 9)和ACAT2(acetoacetyl-COA thiolase 2)以及花药特异表达基因PABP(polyadenylate-binding protein)和LTP12(lipid transfer protein 12),采用荧光定量PCR方法对其在根、茎、叶、花、角果、雌蕊、雄蕊中的表达模式进行分析,进一步阐明了甘蓝型油菜雄性核不育的分子机理。克隆了甘蓝型油菜花药特异基因BnPABP,通过相关生物信息学软件对PABP家族序列进行了分析,对基因结构和功能进行了预测和探讨,以期帮助深入理解甘蓝型油菜雄性核不育的分子机理。研究获得的主要结果陈述如下:1.糖代谢途径相关基因GAPC和AT2G36580在甘蓝型油菜各个组织中均有表达,花蕾发育过程中它们均在可育株四分体至单核期(败育中期)表达量最高,分别是可育株减数分裂期(败育前期)的5.06倍和1.69倍,而在不育株花蕾发育前期和中期被抑制;雌雄蕊中的表达分析表明它们均在不育株雄蕊中被抑制,而在可育株雄蕊中表达量高,分别是不育株雌蕊(对照)的9.11倍和4.47倍。2.脂肪酸代谢途径相关基因LACS9和ACAT2在角果中高量表达,花蕾发育过程中它们在不育株花蕾发育前期和中期被抑制,在可育株花蕾发育中期表达量高,分别是可育株花蕾发育前期的3.28倍和1.39倍;雌雄蕊中的表达分析表明它们均在不育株雄蕊中被抑制,而在可育株雄蕊中表达量高,分别是不育株雌蕊的2.03倍和3.43倍。3.花药特异表达基因PABP和LTP12在花中特异高量表达,在不育株花蕾发育时期被抑制,在可育株花蕾发育前期和中期表达,后期略有差异。雌雄蕊中的表达分析表明它们在在不育株雄蕊中基本不表达,而在可育株雄蕊中特异表达,分别是可育株雌蕊的6.78倍和9.45倍。4.上述基因表达模式的分析表明这六个基因的表达模式具有一定的共性:在可育株花蕾发育过程中,它们在前期和中期表达量上升,后期表达量下降,而在不育株花蕾发育前期和中期它们都被显著抑制。雌雄蕊中的表达分析表明,它们都在可育株雄蕊中高量表达,而在不育株雄蕊中表达量低。这些结果表明,这六个基因尽管属于不同的类别,但它们都同雄性核不育表型密切相关,值得进一步对其功能进行研究。5.通过生物信息学及分子生物学手段对甘蓝型油菜PABP基因进行了分析。首先,克隆获得了全长DNA序列。翻译后发现其包含651个氨基酸,分子量大小约71598.4,等电点约为8.38。通过与拟南芥PABP家族基因比对作出了进化树,甘蓝型油菜BnPABP与拟南芥PABP家族中的PABP5最为相似,氨基酸同源性达到了76%。通过生物学软件Clone Manager5对BnPABP同拟南芥PABP5进行了基因结构分析,发现它们具有类似的结构,即都具有PABP家族的特征保守区域和4个RNA结合区域,三维结构模拟显示二者功能位点结构高度相似。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第1章 综述
  • 1.1 植物细胞核雄性不育的遗传研究
  • 1.1.1 油菜显性细胞核雄性不育的遗传研究
  • 1.1.2 油菜隐性细胞核雄性不育的遗传研究
  • 1.1.3 育性遗传多样性通式
  • 1.2 细胞核雄性不育的细胞学研究
  • 1.2.1 花药发育过程
  • 1.2.2 油菜雄性不育的败育类型
  • 1.3 植物细胞核雄性不育的分子机制研究
  • 1.3.1 绒毡层与细胞核雄性不育
  • 1.3.2 减数分裂与细胞核雄性不育
  • 1.3.3 程序性细胞死亡与细胞核雄性不育
  • 1.3.4 茉莉酸与细胞核雄性不育
  • 1.3.5 碳水化合物与细胞核雄性不育
  • 1.3.6 类黄酮与植物雄性不育
  • 1.4 基因工程技术在雄性不育育种中的应用
  • 1.4.1 外源细胞毒素基因破坏花药绒毡层创造和利用雄性不育
  • 1.4.2 转基因提早降解胼胝质产生雄性不育
  • 1.4.3 借助查尔酮合成酶反义RNA 策略创造植物雄性不育系
  • 1.4.4 利用RNAi 技术创造雄性不育
  • 1.4.5 展望
  • 1.5 本研究的研究背景,目的和意义
  • 1.5.1 研究背景
  • 1.5.2 研究目的及意义
  • 第2章 雄性不育相关基因的表达分析
  • 2.1 材料
  • 2.2 方法
  • 2.2.1 取材
  • 2.2.2 RNA 提取
  • 2.2.3 核酸浓度及质量检测
  • 2.2.4 逆转录
  • 2.2.5 荧光定量PCR
  • 2.2.6 数据处理
  • 2.3 结果与分析
  • 2.3.1 PCR 条件优化和特异产物扩增
  • 2.3.2 糖代谢途径相关基因表达分析
  • 2.3.3 脂肪酸代谢途径相关基因表达分析
  • 2.3.4 花药特异相关基因表达分析
  • PABP 全长基因克隆及序列分析'>第3章 BNPABP 全长基因克隆及序列分析
  • 3.1 材料
  • 3.2 方法
  • 3.2.1 全长序列的确定与分析
  • 3.2.2 PCR 扩增全长DNA 序列
  • 3.2.3 PCR 扩增产物的回收纯化
  • 3.2.4 PCR 扩增产物与T 载体连接
  • 3.2.5 DH5α感受态细胞的制备
  • 3.2.6 连接产物的转化
  • 3.2.7 阳性克隆的菌液PCR 鉴定
  • 3.2.8 重组质粒的提取
  • 3.2.9 序列测定与分析
  • 3.3 结果与分析
  • PABP 全长性的确定'>3.3.1 Unigene 库BnPABP 全长性的确定
  • 3.3.2 全长DNA 扩增及基因结构分析
  • 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 已发表和正在整理的与本研究相关的文章
  • 附录
  • 主要溶液配制
  • 作者简介
  • 相关论文文献

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    油菜雄性不育相关基因的表达差异及克隆与序列分析
    下载Doc文档

    猜你喜欢