家蝇幼虫免疫刺激前后差异蛋白质组及差异表达基因的研究

家蝇幼虫免疫刺激前后差异蛋白质组及差异表达基因的研究

论文摘要

家蝇(Musca domestica)从幼虫到成虫均生活在杂菌横生的环境里,其体表带有多种病原菌,可以传播多种疾病。据报道约有100多个可引起人类和动物疾病的病原体与家蝇有关,包括伤寒、霍乱、杆菌性痢疾、肺结核、炭疽热、婴儿腹泻和一些寄生虫病等。虽然家蝇没有脊椎动物那样高度专一的免疫系统,但是在细菌感染或者其它物理、化学因子的诱导下,其体内可以快速生成免疫活性物质。这些活性物质主要包括多种抗菌肽、溶菌酶、酚氧化酶等。研究表明,家蝇体内的活性物质不仅对多种病毒、细菌、真菌、寄生虫具有杀伤和抑制作用,同时对多种癌细胞也具有杀伤和抑制作用,但是大部分对人体是比较安全的。昆虫体内活性物质的抗菌、抗癌作用是无脊椎动物先天免疫研究的热点之一。目前这些研究主要集中在果蝇(Drosophila melanogaster)、冈比亚按蚊(Anopheles gambiae)棕尾别麻蝇(Boettcherisca peregrinas)等中,已经分离出了多种具有抗菌和抗癌作用的抗菌肽及其它活性物质。在家蝇中的相关研究相对较少。因此,对家蝇的免疫系统的研究具有重要的理论意义和应用价值。本研究利用差异蛋白质组学的方法研究分析了家蝇幼虫血淋巴在细菌刺激前后蛋白质表达的变化。除了在昆虫中已报道的免疫反应蛋白,还确定了几种新的参与免疫反应的蛋白质。本研究还利用抑制性消减杂交的方法构建了家蝇cDNA消减文库,得到数个免疫相关基因和氧化还原酶系相关基因。为进一步克隆家蝇免疫相关基因提供了有价值的信息。然后通过同源克隆的方法从家蝇幼虫体内克隆得到了铜/锌超氧化物歧化酶基因,分析了它在细菌刺激不同时间后的转录模式,并通过原核表达的重组蛋白制备了家兔多克隆抗体,研究了该蛋白在不同组织中翻译模式,最后检测了该蛋白的活性。同时,通过RT-PCR方法分析了另一个免疫相关的泛素融合蛋白基因的转录模式,并通过原核表达获得了纯化的泛素融合蛋白,拟进一步分析其性质。这些研究使我们对家蝇的先天免疫反应有了进一步的认识,为了解家蝇独特的免疫防御机制提供了理论依据。本研究取得的实验结果如下:1.运用差异蛋白质组学的方法分析了细菌免疫刺激后家蝇幼虫血淋巴中蛋白质表达水平的变化。用大肠杆菌和金黄色葡萄球菌混合菌免疫家蝇幼虫后,用双向凝胶电泳的方法来检测血淋巴中蛋白质表达。在双向电泳图谱中共检测到350个蛋白质斑点,288个蛋白质斑点在免疫刺激前后没发生变化,11个蛋白质斑点免疫刺激后上调,37个蛋白质斑点免疫刺激后下调,14个蛋白质斑点只在免疫刺激后幼虫血淋巴样品中能检测到。MALDI-TOF-MS共鉴定了35个差异表达的蛋白质,包括7个免疫相关的蛋白质,如革兰氏阴性菌结合蛋白1,肽聚糖识别蛋白LF,核因子NF-κB p110亚基和溶菌酶X。除了在昆虫中已报道的免疫反应蛋白,还确定了几种新的可能与免疫反应相关的蛋白质,包括类DCN1样蛋白和cAMP依赖的蛋白激酶。另外还有一些参与解毒反应的蛋白质也被鉴定出来,如超氧化物歧化酶,谷胱甘肽硫转移酶,细胞色素P450等。RT-PCR分析了溶菌酶X,谷胱甘肽硫转移酶和超氧化物歧化酶在mRNA水平上的变化,结果显示这些蛋白质在细菌刺激之后转录水平的调节变化与翻译水平的变化是基本一致的的。上述结果表明,这些蛋白质可能参与了家蝇的先天免疫反应,为了解家蝇独特的免疫防御机制提供了理论依据。2.应用抑制性消减杂交技术,构建家蝇幼虫差异表达cDNA消减文库。以大肠杆菌和金黄色葡萄球菌混合菌液刺激的家蝇三龄幼虫与未刺激的同龄家蝇幼虫为消减杂交对象,分别提取mRNA,合成cDNA,刺激的为测试子(tester),不刺激的为驱赶子(driver),经两次消减杂交及两次抑制性PCR后就分离出测试子中差异表达cDNA片段,将差异表达cDNA片段与T载体连接,转化大肠杆菌,获得cDNA消减文库,经蓝白斑筛选和菌落PCR筛选部分阳性克隆进行测序及GenBank BLASTx分析,发现差异表达cDNA片段大部分分布于200-750bp之间,并筛选出数个免疫相关基因和氧化还原酶系相关基因的EST,如防御素基因、细胞色素氧化酶基因、溶菌酶基因、丝氨酸蛋白酶基因、过氧化氢酶基因、氧化还原酶基因,Dicer等。从而为家蝇免疫相关基因的克隆奠定了基础。3.根据GenBank上检索的Cu/Zn SOD mRNA序列,设计基因特异性引物克隆得到基因全长。Cu/Zn SOD基因全长为734bp,包含462bp的开放阅读框。基因的5’端含有9bp的非编码区,3’端含有263bp的非编码区,同时还有一个17 bppolyA尾巴。这一基因编码的蛋白质由153个氨基酸构成。蛋白质经过SMART预测,其中包含一个为Sod Cu结构域,没有信号肽,预测分子量为15.6kDa,理论等电点为5.67。为了进一步确认家蝇幼虫Cu/Zn SOD基因的转录模式,还利用RT-PCR的方法研究了在混合菌刺激后不同时间段这一基因的表达差异。结果显示在细菌刺激后3 h,Cu/Zn SOD表达开始增加,6 h时增至最高值,至12 h又有明显的下降。这一变化趋势说明在家蝇幼虫受到外界刺激后Cu/Zn SOD基因上调表达。这一结果与家蝇幼虫血淋巴的差异蛋白质组学分析所得到的结果一致。根据Cu/Zn SOD基因序列设计表达引物,将基因片段克隆到pGEX-4T-1载体中,转化大肠杆菌BL21(DE3)进行原核表达。重组表达的蛋白在上清中,没有形成包涵体,用Glutathione Sepharose 4B亲和柱直接进行纯化。利用重组表达并纯化的Cu/Zn SOD作为抗原免疫家兔,制备多克隆抗体。利用SOD多克隆抗体研究了SOD蛋白在不同组织中的表达模式。将细菌刺激前后家蝇血淋巴、中肠、脂肪体蛋白进行SDS-PAGE并转硝酸纤维素膜后,用SOD抗血清作为一抗,再用辣根过氧化物酶标记的羊抗兔IgG作为二抗进行Western blot分析。结果表明,天然的SOD蛋白主要存在于中肠和脂肪体中,在血淋巴也有较弱的表达。细菌刺激之后,在各组织中的表达都上调,但是在血淋巴中的上调较微弱。10%非变性聚丙烯酰胺凝胶进行酶的活性检测。实验结果表明,Cu/Zn SOD活性在IPTG诱导3 h以后,显示出明显的酶活性条带,纯化的Cu/Zn SOD也具有明显的酶活性条带。诱导前也有较弱的活性,可能转化菌株存在少量渗漏表达。4.本研究还对家蝇泛素融合基因(MubS27)在细菌刺激之后的表达模式进行分析,并进行了重组表达研究,拟进一步分析其性质。RT-PCR研究发现,在大肠杆菌和金黄色葡萄球菌刺激家蝇幼虫之后MubS27表达上调。通过蛋白质组分析在家蝇体内鉴定出了免疫相关蛋白NF-κB,它在细菌免疫之后诱导表达。MubS27可能在激活NF-κB的过程中起了重要的作用,而NF-κB参与了对细菌的防御过程,这表明MubS27可能在机体细菌防御过程中也发挥着重要功能。根据基因序列设计成熟肽表达引物,将基因片段克隆到载体pET-30a(+)中,转化其感受态细胞进行原核表达。并用His-Bind亲和柱纯化得到纯度较高的重组蛋白。本研究增强了对家蝇免疫防御体系的了解,丰富了对昆虫天然免疫机制的认识。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 符号说明
  • 第一章 综述
  • 第一部分:蛋白质组学研究
  • 一、蛋白质组学及其技术体系
  • 1.蛋白质组与基因组-从基因组到蛋白质组的转变
  • 2.蛋白质组学的研究内容
  • 3.蛋白质组学研究技术
  • 3.1 蛋白质组研究中的样品制备技术
  • 3.2 蛋白质分离技术
  • 3.3 蛋白质定量分析
  • 3.4 蛋白质的鉴定
  • 3.5 蛋白质间的相互作用技术
  • 3.6 生物信息学分析
  • 二、差异蛋白质组学
  • 1.差异蛋白质组学的产生背景
  • 2.差异蛋白质组学研究技术的进展
  • 2.1 蛋白质样品制备研究进展
  • 2.2 蛋白质的双向电泳研究进展
  • 2.3 蛋白质鉴定技术研究进展
  • 三、昆虫差异蛋白质组学研究进展
  • 1.免疫诱导蛋白质组
  • 2.抗性相关蛋白质组
  • 第二部分:先天免疫研究进展
  • 一、无脊椎动物的先天免疫
  • 1.先天免疫的非自身识别
  • 2.先天免疫的信号转导
  • 3.效应物系统
  • 二、蝇类的先天免疫
  • 1.细胞免疫
  • 2.体液免疫
  • 2.1 蝇类抗菌肽
  • 2.2 凝集素
  • 2.3 丝氨酸蛋白酶
  • 2.4 酚氧化酶
  • 2.5 溶菌酶
  • 2.6 蝇蛆分泌物
  • 3.研究目的及意义
  • 第二章 家蝇幼虫血淋巴差异蛋白质组研究
  • 一、前言
  • 二、材料和方法
  • 1.材料
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 试剂和仪器
  • 2.方法
  • 2.1 刺激家蝇幼虫
  • 2.2 蛋白样品制备
  • 2.3 Bradford法测定蛋白浓度
  • 2.4 SDS-PAGE
  • 2.5 2-DE图谱的获得
  • 2.6 差异蛋白点的质谱鉴定
  • 2.7 RT-PCR
  • 三、结果
  • 四、讨论
  • 第三章 家蝇消减文库构建及差异表达基因鉴定
  • 一、前言
  • 二、材料和方法
  • 1.材料和试剂
  • 1.1 材料
  • 1.2 试剂
  • 2.方法
  • 2.1 诱导与非诱导家蝇幼虫总RNA提取与检测
  • 2.2 逆转录mRNA
  • 2.3 cDNA消减文库构建
  • 2.4 扩增产物克隆
  • 2.5 测序及序列分析
  • 三、结果
  • 1.双链cDNA琼脂糖凝胶电泳
  • 2.抑制性消减杂交结果
  • 3.SSH文库筛选与差异表达基因鉴定
  • 四、讨论
  • 1.SSH技术的优缺点
  • 2.测序结果讨论
  • 第四章 铜/锌超氧化物歧化酶基因的克隆、重组表达及性质研究
  • 一、前言
  • 二、材料和方法
  • 1.材料
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 菌株和载体
  • 1.3 试剂和仪器
  • 2.方法
  • 2.1 RNA提取
  • 2.2 cDNA合成
  • 2.3 SOD基因扩增与克隆
  • 2.4 序列分析
  • 2.5 RT-PCR
  • 2.6 重组表达、蛋白纯化及抗体制备
  • 2.7 蛋白活性检测
  • 三、结果
  • 1.基因克隆
  • 2.序列分析
  • 3.序列比对
  • 4.RT-PCR分析
  • 5.重组表达及蛋白纯化
  • 6.Western blot分析
  • 7.蛋白活性检测
  • 四、讨论
  • 第五章 泛素的表达模式及重组表达研究
  • 一、前言
  • 二、材料和方法
  • 1.材料
  • 1.1 实验材料
  • 1.2 菌株和载体
  • 2.方法
  • 2.1 RNA提取
  • 2.2 cDNA合成
  • 2.3 RT-PCR
  • S27的重组表达和蛋白纯化'>2.4 MubS27的重组表达和蛋白纯化
  • 三、结果
  • 1.RT-PCR
  • S27的诱导表达和蛋白纯化'>2.重组蛋白pET-30a(+)-MubS27的诱导表达和蛋白纯化
  • 四、讨论
  • 论文总结
  • 参考文献
  • 致谢
  • 已发表和写作中的论文
  • 学位论文评阅及答辩情况表
  • 附发表文章
  • 相关论文文献

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