青岛文昌鱼Antithrombin基因的克隆、表达和功能分析

青岛文昌鱼Antithrombin基因的克隆、表达和功能分析

论文摘要

凝血是一个由多种蛋白质因子参与的复杂的级联过程。在哺乳动物中,与凝血相关的因子都是高度保守的。除此之外,在两栖类,爬行类,鱼类和鸟类中也发现了类似功能的凝血系统的相关因子。最近研究表明无颌类七鳃鳗中含有类似脊椎动物的凝血因子,但是在尾索动物海鞘中并没有发现类似的凝血因子存在。文昌鱼(amphioxus)是介于无脊椎动物和脊椎动物之间的过渡类型,是现存的与脊椎动物祖先最接近的原索动物,是研究脊椎动物起源和进化的重要模式动物。研究文昌鱼体内是否存在凝血系统的相关因子对于探索凝血系统的起源与进化有着重要的意义。抗凝血酶(antithrombin)是丝氨酸蛋白酶抑制剂家族(serpin)的成员之一,是凝血系统中的一个关键蛋白,作为凝血酶的主要抑制剂在血液凝集过程中维持着凝血与抗凝的平衡。本文克隆了青岛文昌鱼(Branchiostoma belcheri tsingtaunese)的抗凝血酶基因,命名为BbAT,并对它的结构、进化、表达和功能进行了研究。首先,利用兼并引物PCR和RACE技术克隆得到了具有完整编码框的文昌鱼的抗凝血酶基因(BbAT),并利用生物信息学方法对其基因结构及系统进化地位进行分析。该cDNA的阅读框编码338个氨基酸,在1-336个氨基酸残基之间包含一个完整的serpin结构域。系统进化分析表明它属于serpin超家族的C分支(antithrombin),但是与B分支(较古老的一类serpin)也有一定的同源性。进一步将BbAT和其他物种的antithrombin比较,发现此蛋白分别和爪蟾,鸵鸟,和人的antithrombin同源性较高,大约有40%的同源性。对BbAT的结构预测表明:其3个β-折叠和7个α-螺旋的结构与人的类似,尤其是它的反应中心环(RCL)在氨基酸组成上与脊椎动物的具有高度的相似性,这表明BbAT的功能很可能与脊椎动物的类似。哺乳动物的肝脏是antithrombin基因的主要合成器官,其他脏器如肺、脾、肾、心、肠、脑等也有少量合成。长期以来,文昌鱼的肝盲囊一直被认为是脊椎动物肝脏的前体。利用原位杂交技术检测BbAT在mRNA水平上在成体文昌鱼中的组织表达模式,结果表明BbAT基因在肝盲囊表达量较高,在卵巢、后肠、腮也有表达,而在精巢、肌肉、神经管和脊索没有杂交信号。可见,与哺乳动物类似,BbAT基因在成体文昌鱼组织中呈组织特异性表达。为了了解文昌鱼的BbAT是否与脊椎动物的一样具有抑制凝血酶的功能。本文利用毕赤酵母表达系统体外表达了BbAT的重组蛋白,命名为rBbAT。并用原核表达的重组蛋白制备了多克隆抗体,分别用发色底物法和Western blot的方法验证了rBbAT的蛋白功。利用发色底物试剂盒,根据以人的标准血浆为标准品制得的标准曲线,得出rBbAT抑制凝血酶的活力呈浓度依赖性,且肝素对它的抑制活力有一定的促进作用。另外rBbAT可以与凝血酶形成一种稳定的复合物,且体内也存在着的天然BbAT也有类似功能。综合以上结果,我们认为:文昌鱼体内存在着一类antithrombin,且其功能与脊椎动物的antithrombin类似。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 文献综述
  • 1 文昌鱼
  • 1.1 文昌鱼概述
  • 1.2 文昌鱼是分子发育进化生物学模式动物
  • 1.3 文昌鱼的分子生物学研究
  • 1.3.1 文昌鱼基因的克隆
  • 1.3.2 文昌鱼与比较基因组学和进化
  • 2 抗凝血酶研究进展
  • 2.1 AT 的蛋白质结构
  • 2.2 AT 与肝素的结合
  • 2.3 AT 的RCL 结构中心
  • 2.4 AT 的合成及水解失活
  • 2.5 AT 的基因结构及体外表达
  • 2.6 AT 的分类与进化
  • 3 研究目的和技术路线
  • 第二章 BBAT 基因全长的克隆及序列分析
  • 1 前言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 材料和试剂
  • 2.1.1 成体文昌鱼
  • 2.1.2 实验试剂及配制方法
  • 2.2 实验方法
  • 2.2.1 文昌鱼总RNA 的分离
  • 2.2.2 BbAT 基因全长的克隆
  • 2.2.3 序列比较与系统进化分析
  • 2.2.4 结构预测
  • 3 结果与讨论
  • 3.1 文昌鱼总RNA 的提取
  • 3.2 BbAT 的序列和结构
  • 3.2.1 BbAT 基因保守片段的PCR 扩增
  • 3.2.2 3’RACE 扩增文昌鱼BbAT 基因的3’cDNA 末端
  • 3.2.3 5’RACE 扩增文昌鱼BbAT 基因的5’cDNA 末端
  • 3.2.4 序列分析
  • 3.3 讨论
  • 第三章 BBAT 基因在文昌鱼成体中的组织表达
  • 1 前言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 RNA 探针的合成和标记效率检测
  • 2.2 切片原位杂交分析BbAT 基因在各组织中的表达
  • 2.2.1 文昌鱼材料固定
  • 2.2.2 文昌鱼组织块的包埋
  • 2.2.3 载玻片的处理
  • 2.2.4 切片
  • 2.2.5 脱蜡复水
  • 2.2.6 处理及杂交
  • 3 结果
  • 4 讨论
  • 第四章 BBAT 基因的体外重组表达及功能研究
  • 1 前言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 多克隆抗体的制备
  • 2.1.1 BbAT 在大肠杆菌中的表达
  • 2.1.2 多克隆抗体的制备
  • 2.1.3 抗体的特异性的Western blot 检测
  • 2.2 BbAT 基因的毕赤酵母表达
  • 2.2.1 菌株与质粒
  • 2.2.2 酵母表达和纯化中的培养基和主要试剂的配制
  • 2.2.3 pPICZαA/BbAT 真核表达载体的构建及鉴定
  • 2.2.4 毕赤酵母的电转化
  • 2.2.5 BbAT 在毕赤酵母中的表达和纯化
  • 2.3 发色底物法检测rBbAT 活性
  • 2.4 BbAT-目标酶复合物检测
  • 2.4.1 样品与试剂
  • 2.4.2 方法
  • 3 结果与讨论
  • 3.1 多克隆抗体的制备
  • 3.1.1 BbAT 基因ORF 的PCR 扩增
  • 3.1.2 pET28a-BbAT 表达载体的构建
  • 3.1.3 重组pET28a-BbAT 在大肠杆菌中的表达、纯化
  • 3.1.4 多克隆抗体制备及Western blot 检测
  • 3.2 BbAT 在酵母中的表达
  • 3.2.1 载体的构建和鉴定
  • 3.2.2 Mut+的鉴定
  • 3.2.3 重组蛋白的表达和纯化
  • 3.3 发色底物法检测rBbAT 活性
  • 3.4 BbAT-目标酶复合物的检测
  • 总结与展望
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简介
  • 发表的学术论文
  • 相关论文文献

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