鲤鱼IECs GLS和TOR基因cDNA克隆及Gln对IECs蛋白合成的影响和机理研究

鲤鱼IECs GLS和TOR基因cDNA克隆及Gln对IECs蛋白合成的影响和机理研究

论文摘要

本研究率先研究建立的鲤鱼(Cyprinus carpio)悬浮原代肠上皮细胞(IECs)研究模型,进一步利用该研究模型结合同位素示踪技术,分子克隆、生物信息学和荧光定量方法,克隆了IECs谷氨酰胺酶(GLS)和蛋白合成信号调控分子雷帕霉素靶(TOR)基因cDNA序列,研究了GLS和TOR基因在鲤鱼肠道不同部位的表达及GLS活力分布,探索了Gln对鲤鱼肠道不同肠段IECs蛋白质合成能力的影响及机理。结果如下:1.研究建立了鲤鱼悬浮原代IECs研究模型。结果表明:分离鲤鱼IECs呈圆形,可见明显两极特征,纯度95%,活力93%,分离IECs提取的DNA纯度更高,提取的总RNA结构完整。结果表明:该模型可应用于PCR分子生物实验研究。2.克隆了鲤鱼IECs GLS基因cDNA序列。该序列长1788bp,包含从起始密码子1位到末端终止密码子1788位的开放阅读框,编码595个氨基酸残基的GLS蛋白前体,分子量65.96kDa。核苷酸序列与斑马鱼的相似性为89.9%,与原鸡的相似性为69.4%,与小鼠K-和L-GLS的相似性分别为70.2%和65.2%,与大鼠K-和L-GLS的相似性分别为70.4%和65.9%,与人K-和L-GLS的相似性分别为69.8%和64.3%。蛋白质结构分析表明:鲤鱼GLS氨基酸残基序列含有两个非常保守的区域,分别为171~457位氨基酸残基的GLS蛋白家族区域和484~570位氨基酸残基的锚定蛋白重复序列;氨基酸残基中118、355、409、438和502位的丝氨酸残基磷酸化位点,205位的苏氨酸残基磷酸化位点和393、511位的酪氨酸残基磷酸化位点高度保守,是GLS蛋白功能调控位点;含有10个高度保守的半胱氨酸残基,位于GLS蛋白家族区域和锚定蛋白重复序列,与GLS蛋白分子结构稳定性和亚细胞定位密切相关。3.克隆了鲤鱼IECs TOR基因cDNA序列。该序列长7548bp,包含从起始密码子1位到末端终止密码子7548位的开放阅读框,编码2515个氨基酸残基的TOR蛋白,分子量为286.03kDa。核苷酸序列与斑马鱼相似性为92.0%,与原鸡相似性为78.0%,与鸭嘴兽、小鼠和大鼠相似性分别为74.5、78.4和78.5%,与人相似性为78.6%。蛋白质结构分析表明:鲤鱼TOR蛋白的1~348氨基酸残基为HEAT重复序列;349~2515位氨基酸残基为PIKKs蛋白质家族结构域,包括1365~1948位的FAT结构域,1985~2078位的FRB结构域(FKBP12-RAP复合物结合区域),2119~2397位的激酶催化区域,2485~2515位的FATC结构域,这些结构域序列非常保守,对TOR蛋白空间构象和生物活性非常重要;N-端931~1039氨基酸残基序列含有内质网和高尔基体的定位序列,对TOR蛋白定位于内质网和高尔基体膜非常重要。4.研究了鲤鱼不同肠段谷丙转氨酶(AlaAT)、谷草转氨酶(AspAT)、谷氨酸脱氢酶(GDH)、苹果酸脱氢酶(MDH)和乳酸脱氢酶(LDH)活力大小。结果表明:AlaAT活力,5肠段显著高于其它各肠段(P<0.05),3肠段显著高于1~2、4和6~7肠段(P<0.05),2、4肠段显著高于1、6~7肠段(P<0.05),1与6~7肠段差异不显著(P>0.05):AspAT活力,2肠段显著高于其它各肠段(P<0.05),3~5肠段显著高于1、6~7肠段,1与6~7肠段差异不显著(P>0.05):GDH活力,3肠段显著高于其它各肠段(P<0.05),2与4~6肠段差异不显著(P>0.05),但显著高于1、7肠段(P<0.05),1与7段差异不显著(P>0.05);MDH活力,3肠段显著高于其它各肠段(P<0.05),2肠段显著高于1、4~7肠段(P<0.05),4肠段显著高于1、5~7肠段(P<0.05),1与5肠段差异不显著(P>0.05),但显著高于6~7肠段(P<0.05),6与7肠段差异不显著(P>0.05);LDH活力,2肠段显著高于其它各肠段(P<0.05),4肠段显著高于1、3和5~7肠段(P<0.05),3肠段显著高于1、5~7肠段(P<0.05),1与5~7肠段差异不显著(P>0.05)。结果说明:AlaAT、AspAT、GDH、MDH和LDH活力均以鲤鱼中肠(2~5肠段)较高。5.研究了鲤鱼不同肠段GLS活力大小和基因表达。结果表明:不同肠段GLS活力,3~4肠段显著高于1~2肠段和6~7肠段(P<0.05),5肠段显著高于1、6~7肠段(P<0.05),2肠段显著高于1、7肠段(P<0.05),6肠段显著高于1、7肠段(P<0.05),1肠段显著高于7肠段(P<0.05),5、2~4肠段之间及2、6肠段之间差异不显著(P>0.05)。不同肠段GLS mRNA表达量,3~4肠段显著高于7肠段(P<0.05),其余各肠段差异不显著(P>0.05),其分布规律与GLS活力基本相同。结果说明:鲤鱼中肠(2~5肠段)GLS活力和mRNA表达量均较高。6.研究了生长期不同体重鲤鱼不同肠段TOR基因表达量。结果表明:1肠段,18.1g组TOR mRNA相对表达量显著低于其它各体重组(P<0.05),18.1、31.1g组之间以及40.6、58.0、73.9g组之间差异不显著(P>0.05);2~5肠段和6~7肠段,18.1g和31.1g组TOR mRNA相对表达量显著低于其它各体重组(P<0.05),18.1、31.1g组之间以及40.6、58.0、73.9g组之间差异不显著(P>0.05)。40.6、58.0、73.9g组TOR mRNA相对表达量各肠段之间差异不显著(P>0.05),但是18.1g组1肠段显著高于6~7肠段,31.1g组1肠段则显著高于2~5肠段和6~7肠段(P<0.05)。结果说明:随体重增加,鲤鱼肠道TOR mRNA表达量增加,同时在幼龄阶段(30g前)前中肠表达量高。7.研究了鲤鱼肠道不同肠段IECs蛋白质合成能力及Gln对不同肠段IECs合成能力的影响。结果表明:蛋白质合成率2~3肠段显著高于其它各肠段(P<0.05),1肠段显著高于4~7肠段(P<0.05),4肠段显著高于5~7肠段(P<0.05),5~7肠段差异不显著(P>0.05);1mg/L Gln组1~3肠段IECs蛋白质合成率显著高于0mg/L Gln组(P<0.05),但4~7肠段则差异不显著(P>0.05)。结果说明:鲤鱼前中肠(1~3肠段)蛋白合成能力高于后肠(5~7肠段),Gln可提高前中肠(1~3肠段)IECs蛋白质合成能力。8.TOR抑制剂RAP、GLS抑制剂DON和Gln对鲤鱼IECs蛋白质合成的影响。结果表明:1mg/L Gln组蛋白质合成率显著高于0mg/L Gln组(P<0.05);1mg/L Gln+RAP、1mg/L Gln+DON和1mg/L Gln+RAP+DON组均显著低于1mg/L Gln组(P<0.05),高于0mg/L Gln组(P<0.05);1mg/L Gln+DON组显著高于1mg/L Gln+RAP和1mg/L GlnRAP+DON组(P<0.05);1mg/L Gln+RAP组显著高于1mg/L Gln+RAP+DON组(P<0.05)。结果说明:GLS和TOR信号分子参与了Gln提高鲤鱼IECs蛋白质合成的调控。9.研究了Gln对鲤鱼IECs GLS基因表达的影响。结果表明:30~120min,1mg/L Gln组GLS mRNA相对表达量显著高于0mg/LGln组(P<0.05);1mg/LGln组中,120min GLSmRNA相对表达量显著低于70min(P<0.05),与30min差异不显著(P>0.05):0mg/LGln组中,30~120min,GLS mRNA相对表达量差异不显著(P>0.05)。结果说明:Gln促进了鲤鱼IECs GLS基因表达。10.研究了Gln、TOR抑制剂RAP和GLS抑制剂DON对鲤鱼IECs TOR基因表达的影响。结果表明:1mg/L Gln组IECs TOR mRNA相对表达量显著高于0mg/L Gln组(P<0.05);1mg/L Gln+RAP组显著低1mg/L Gln组(P<0.05),与0mg/L Gln差异不显著(P>0.05);1mg/L Gln+DON组与1mg/L Gln差异不显著(P>0.05),但显著高于1mg/LGln+RAP组和0mg/L Gln组(P<0.05)。Gln作用时间,15min,30min组IECs TOR mRNA相对表达量显著高于5min组(P<0.05);30min与15min组之间差异不显著(P>0.05)。结果说明:Gln可通过TOR信号分子调控TOR基因表达,提高了TOR mRNA表达量;GLS没有参与Gln对鲤鱼IECs TOR基因表达的调控过程。综上所述:在鲤鱼肠道存在IECs蛋白合成信号调控分子TOR,随着体重增加,TORmRNA在肠道中表达量逐步增加,30g前幼龄鲤鱼前中肠表达量高;鲤鱼前中肠IECs蛋白质合成能力强;Gln提高前中肠IECs蛋白质的合成能力,Gln提高其蛋白质合成能力受到TOR和GLS的调控。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 缩略符号表
  • 目录
  • 前言
  • 1 文献综述
  • 1.1 鱼类IECs研究模型及其应用
  • 1.2 Gln对IECs蛋白质合成的影响
  • 1.3 肠道GLS结构、分布和活性调节
  • 1.4 TOR与细胞蛋白质合成调控
  • 1.5 存在的问题
  • 1.6 本研究的目的和意义
  • 2 试验一 鲤鱼悬浮原代IECs研究模型的建立
  • 2.1 材料与方法
  • 2.2 结果
  • 2.3 讨论
  • 2.4 小结
  • 3 试验二 鲤鱼不同肠段AlaAT、AspAT、GDH、MDH和LDH活力
  • 3.1 材料与方法
  • 3.2 结果
  • 3.3 讨论
  • 3.4 小结
  • 4 试验三 鲤鱼IECs GLS基因cDNA克隆与序列分析
  • 4.1 材料与方法
  • 4.2 结果
  • 4.3 讨论
  • 4.4 小结
  • 5 试验四 鲤鱼IECs TOR基因cDNA克隆与序列分析
  • 5.1 材料与方法
  • 5.2 结果
  • 5.3 讨论
  • 5.4 小结
  • 6 试验五 鲤鱼不同肠段GLS活力和基因表达
  • 6.1 材料与方法
  • 6.2 结果
  • 6.3 讨论
  • 6.4 小结
  • 7 试验六 不同体重阶段鲤鱼不同肠段TOR基因表达
  • 7.1 材料与方法
  • 7.2 结果
  • 7.3 讨论
  • 7.4 小结
  • 8 试验七 Gln对鲤鱼IECs蛋白质合成的影响
  • 8.1 材料与方法
  • 8.2 结果
  • 8.3 讨论
  • 8.4 小结
  • 9 试验八 Gln调控鲤鱼IECs蛋白质合成力机制初探
  • 9.1 材料与方法
  • 9.2 结果
  • 9.3 讨论
  • 9.4 小结
  • 10 试验九 Gln对鲤鱼IECs GLS基因表达的影响
  • 10.1 材料与方法
  • 10.2 结果
  • 10.3 讨论
  • 10.4 小结
  • 11 试验十 Gln对鲤鱼IECs TOR基因表达的影响
  • 11.1 材料与方法
  • 11.2 结果
  • 11.3 讨论
  • 11.4 小结
  • 12 主要结论、创新点及有待于进一步研究的问题
  • 12.1 主要结论
  • 12.2 创新点
  • 12.3 有待于进一步研究的问题
  • 附录
  • 致谢
  • 攻读学位期间发表的学术论文目录
  • 参考文献
  • 相关论文文献

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