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天府肉羊GH基因多态性及其与生长性状的关联性研究

2020-11-29阅读(457)

天府肉羊GH基因多态性及其与生长性状的关联性研究

论文摘要

本实验以四川农业大学新近选育成功的250只天府肉羊为试验材料,其中黑头羊41只（B）、红头羊137只（R）,白头羊72只（W）,采用PCR-SSCP方法检测生长激素基因（GH）外显子2、3、5区域的多态性及其与生长性状的相关性,结果表明:3对引物的扩增片段均存在多态性,外显子2、3、5区域内各检测到1个变异位点,共计3个变异位点,分别为669bp、1057bp和1830bp处。669bp处为G→A的单碱基突变（Gly35Ser）,1057bp处为G→A的单碱基突变（Gly89Ser）,1830bp处T→C的单碱基突变。669位点在天府肉羊群体中存在等位基因A和B,基因频率分别为0.534和0.466。有三种基因型:AA、AB和BB,基因频率分别为0.152、0.764和0.084。AB基因型的2月龄体重、6月龄体重和体长及周岁体高显著高于AA和BB型（P＜0.05）;AB基因型的成年体重、体高、体长和胸围极显著高于AA和BB型（P＜0.01）;AB基因型的周岁体重极显著高于BB型（P＜0.01）,显著高于AA型（P＜0.05）,AB型的周岁体长和胸围极显著高于AA型（P＜0.01）,显著高于BB型（P＜0.05）。1057位点在天府肉羊群体中存在等位基因C和D,基因频率分别为0.734和0.266。有三种基因型:CC、CD和DD,基因频率分别是0.652、0.184和0.164。CC基因型的成年体重极显著高于CD型和DD型（P＜0.01）,CC型和DD型的6月龄胸围极显著高于CD型（P＜0.01）。1830位点在天府肉羊群体中存在等位基因E和F,基因频率为0.722和0.278。有三种基因型:髓、EF和FF,基因型频率分别是0.64、0.164和0.196。EE基因型与FF基因型2月龄体长的差异不显著,均显著高于EF型（P＜0.05）;FF型的2月龄胸围显著高于EF型（P＜0.05）,EE型与EF型和FF型的差异不显著（P＞0.05）;EF型和FF型的周岁胸围差异不显著,均显著高于EE型（P＜0.05）;EF型的成年胸围极显著高于EE型（P＜0.01）。R和W头系各阶段的体重差异不显著（P＞0.05）,均显著高于B头系（P＜0.05）;其余生长性状差异不显著。外显子2、3、5的多态信息含量分别为0.374,0.314和0.375,均为中度多态,表明以上三个位点在群体中有较高的遗传变异。3个位点的χ2值检验均极显著的偏离了Hardy-Weinberg平衡状态（P＜0.01）。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 1 文献综述
  • 1.1 概述
  • 1.1.1 生长激素的发现和作用
  • 1.1.2 GH的表达和调控
  • 1.2 GH基因的研究进展
  • 1.2.1 GH基因的结构、定位
  • 1.2.2 GH基因在家畜上的研究
  • 1.3 山羊生产性能的研究
  • 1.4 本试验的理论依据
  • 1.5 研究背景
  • 1.6 本研究的目的和意义
  • 2 材料与方法
  • 2.1 试验材料
  • 2.1.1 采集血样
  • 2.1.2 主要仪器设备
  • 2.1.3 引物合成
  • 2.1.4 主要试剂及配制
  • 2.2 试验方法
  • 2.2.1 总DNA的提取
  • 2.2.2 DNA浓度和纯度的检测
  • 2.2.3 引物的设计与合成
  • 2.2.4 PCR产物的检测
  • 2.2.5 PCR扩增的PCR-SSCP分析及基因型判定
  • 2.3 数据处理与统计分析
  • 3 试验结果
  • 3.1 基因组DNA抽提结果
  • 3.2 PCR扩增结果
  • 3.3 PCR-SSCP多态性检测结果
  • 3.4 GH基因3‘端部份序列测序结果
  • 3.5 天府肉羊GH基因基因频率和基因型频率分析
  • 3.5.1 669位点的基因频率和基因型频率分析
  • 3.5.2 1057位点的基因频率和基因型频率分析
  • 3.5.3 1830位点的基因频率和基因型频率分析
  • 2检验、多态信息含量、杂合度及有效等位基因数'>3.5.4 群体的χ2检验、多态信息含量、杂合度及有效等位基因数
  • 3.6 GH基因不同多态位点与天府肉羊生长性状的关联分析
  • 3.6.1 位点669不同基因型与生长性状的关联分析
  • 3.6.2 位点1057不同基因型与生长性状的关联分析
  • 3.6.3 位点1830不同基因型与生长性状的关联分析
  • 3.7 不同头色与生长性状的关联分析
  • 4 讨论
  • 4.1 关于实验方法的优化
  • 4.1.1 DNA抽提方法的优化
  • 4.1.2 PCR-SSCP技术的优化
  • 4.2 GH基因在天府肉羊中遗传特性的分析
  • 4.3 天府肉羊GH基因核苷酸多态位点分析
  • 4.4 GH基因对天府肉羊经济性状的影响
  • 4.4.1 GH基因外显子2多态位点各基因型与生长性状的关系
  • 4.4.2 GH基因外显子3多态位点各基因型与生长性状的关系
  • 4.4.3 GH基因外显子5多态位点各基因型与生长性状的关系
  • 4.5 不同头色对天府肉羊经济性状的影响
  • 4.6 天府肉羊群体遗传多样性与保护
  • 4.7 GH基因的应用前景
  • 5 结论
  • 参考文献
  • 致谢

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