本文主要研究内容
作者陈桦（2019）在《菌株M-1、W-1-1以及H-3-1降解酚类化合物的相关研究》一文中研究指出：对分离自苏北盐城海岸带盐沼地区的3株菌M-1、W-1-1和H-3-1进行了系统生物学鉴定,结果如下:M-l、W-1-1、H-3-1均为革兰氏阴性菌,无芽孢结构,不含有Fexirubin色素。3株菌都可以利用的碳源有醋酸盐、木糖、葡萄糖胺、DNA肉汤、尿素、葡萄糖、葡萄糖酸盐。除此之外,M-1可以利用的碳源有七叶苷、鸟氨酸、酒石酸盐、硫化氢、精氨酸双水解酶、丙二酸盐。W-1-1能利用的碳源有鸟氨酸、山梨醇、酒石酸盐、精氨酸双水解酶、甘露醇、丙二酸盐。H-3-1可以利用的碳源有肌醇、纤维二糖、苯丙氨酸、甘露醇、核糖。最适生长条件的结果显示,M-1、W-1-1、H-3-1的最适生长温度都是30℃C,最适生长盐度为0%,最适生长pH值为7。M-1的对数生长期为12-36h,W-1-1的对数生长期为18-42h,H-3-1的对数生长期为6-24h。通过16S rDNA测序结果和系统发育分析,初步认定M-MMMc1为Acinetnboctar sp.,W-1-1为Brachybacrium sp.,H-3-1为Neomicroccus sp.。M-1、W-1-1、H-3-1对苯酚、4-氯苯酚、4-硝基苯酚降解能力的研究结果显示,H-3-1对三种污染物均没有降解。但是,M-1和W-1-1对苯酚都可以在48h之内完全降解400mg/L苯酚,其中M-1的降解更加快速。对于4-氯苯酚的降解,M-1和W-1-1在48h的观测范围内均显示出降解的趋势,但是降解程度并不显著。而对于4-硝基苯酚的降解,W-1-1在48h内几乎不表现出降解的趋势,而M-1也仅仅表现出微弱且不明显的降解趋势。综合考虑,选择M-1作为代表性菌株并选择苯酚作为基础结构的化合物,进行降解机制的进一步研究。结合iTRAQ技术和Label-free技术的蛋白质组学的研究表明M-1降解苯酚是通过邻位代谢途径进行降解的。苯酚先生成邻苯二酚,然后开环生成链状的粘糠酸,进一步代谢生成粘康酸内酯,最终生成琥珀酰辅酶A和乙酰辅酶A,进入三羧酸循环矿化。此外,对显著上调的差异蛋白的KEGG注释,其中注释得到的一条氯代环已烷和氯苯的降解通路(Chlorocyclohexane and chlorobenzene degradation)中存在一条4-氯苯酚降解的细小分支,并且M-1的显著上调的差异蛋白参与了4-氯苯酚的降解过程。这个结果提示,M-1确实具有降解4-氯苯酚的能力。通过iTRAQ技术、label-free的两种相对定量方法(谱图技术法和质谱峰面积强度法)在筛选M-1降解苯酚的差异蛋白的过程中的比较分析显示,三种方法均可以很好的筛选出差异蛋白,并且通过GO、KEGG注释,这些得到的差异蛋白均表现出一定程度的与苯酚代谢的相关性。但是相较于label技术的两种相对定量方法,通过iTRAQ技术得到的差异蛋白中包括了苯酚羟化酶(Phenol hydroxylase)和 L-丙氨酸-DL-谷氨酸差向异构酶(L-alanine-DL-glutamate epimerase),而Label-free的两种方法并没有得到。苯酚轻化酶(Phenol hydroxylase)和L-丙氨酸-DL-谷氨酸差向异构酶(L-alanine-DL-glutamate epimerase)均是微生物代谢苯酚以及其它酚类化合物中重要蛋白。通过PCR扩增鉴定了M-1中存在编码苯酚经化酶(Phenol hydroxylase)的基因。
Abstract
dui fen li zi su bei yan cheng hai an dai yan zhao de ou de 3zhu jun M-1、W-1-1he H-3-1jin hang le ji tong sheng wu xue jian ding ,jie guo ru xia :M-l、W-1-1、H-3-1jun wei ge lan shi yin xing jun ,mo ya bao jie gou ,bu han you Fexirubinse su 。3zhu jun dou ke yi li yong de tan yuan you cu suan yan 、mu tang 、pu tao tang an 、DNArou shang 、niao su 、pu tao tang 、pu tao tang suan yan 。chu ci zhi wai ,M-1ke yi li yong de tan yuan you qi xie gan 、diao an suan 、jiu dan suan yan 、liu hua qing 、jing an suan shuang shui jie mei 、bing er suan yan 。W-1-1neng li yong de tan yuan you diao an suan 、shan li chun 、jiu dan suan yan 、jing an suan shuang shui jie mei 、gan lou chun 、bing er suan yan 。H-3-1ke yi li yong de tan yuan you ji chun 、qian wei er tang 、ben bing an suan 、gan lou chun 、he tang 。zui kuo sheng chang tiao jian de jie guo xian shi ,M-1、W-1-1、H-3-1de zui kuo sheng chang wen du dou shi 30℃C,zui kuo sheng chang yan du wei 0%,zui kuo sheng chang pHzhi wei 7。M-1de dui shu sheng chang ji wei 12-36h,W-1-1de dui shu sheng chang ji wei 18-42h,H-3-1de dui shu sheng chang ji wei 6-24h。tong guo 16S rDNAce xu jie guo he ji tong fa yo fen xi ,chu bu ren ding M-MMMc1wei Acinetnboctar sp.,W-1-1wei Brachybacrium sp.,H-3-1wei Neomicroccus sp.。M-1、W-1-1、H-3-1dui ben fen 、4-lv ben fen 、4-xiao ji ben fen jiang jie neng li de yan jiu jie guo xian shi ,H-3-1dui san chong wu ran wu jun mei you jiang jie 。dan shi ,M-1he W-1-1dui ben fen dou ke yi zai 48hzhi nei wan quan jiang jie 400mg/Lben fen ,ji zhong M-1de jiang jie geng jia kuai su 。dui yu 4-lv ben fen de jiang jie ,M-1he W-1-1zai 48hde guan ce fan wei nei jun xian shi chu jiang jie de qu shi ,dan shi jiang jie cheng du bing bu xian zhe 。er dui yu 4-xiao ji ben fen de jiang jie ,W-1-1zai 48hnei ji hu bu biao xian chu jiang jie de qu shi ,er M-1ye jin jin biao xian chu wei ruo ju bu ming xian de jiang jie qu shi 。zeng ge kao lv ,shua ze M-1zuo wei dai biao xing jun zhu bing shua ze ben fen zuo wei ji chu jie gou de hua ge wu ,jin hang jiang jie ji zhi de jin yi bu yan jiu 。jie ge iTRAQji shu he Label-freeji shu de dan bai zhi zu xue de yan jiu biao ming M-1jiang jie ben fen shi tong guo lin wei dai xie tu jing jin hang jiang jie de 。ben fen xian sheng cheng lin ben er fen ,ran hou kai huan sheng cheng lian zhuang de nian kang suan ,jin yi bu dai xie sheng cheng nian kang suan nei zhi ,zui zhong sheng cheng hu po xian fu mei Ahe yi xian fu mei A,jin ru san suo suan xun huan kuang hua 。ci wai ,dui xian zhe shang diao de cha yi dan bai de KEGGzhu shi ,ji zhong zhu shi de dao de yi tiao lv dai huan yi wan he lv ben de jiang jie tong lu (Chlorocyclohexane and chlorobenzene degradation)zhong cun zai yi tiao 4-lv ben fen jiang jie de xi xiao fen zhi ,bing ju M-1de xian zhe shang diao de cha yi dan bai can yu le 4-lv ben fen de jiang jie guo cheng 。zhe ge jie guo di shi ,M-1que shi ju you jiang jie 4-lv ben fen de neng li 。tong guo iTRAQji shu 、label-freede liang chong xiang dui ding liang fang fa (pu tu ji shu fa he zhi pu feng mian ji jiang du fa )zai shai shua M-1jiang jie ben fen de cha yi dan bai de guo cheng zhong de bi jiao fen xi xian shi ,san chong fang fa jun ke yi hen hao de shai shua chu cha yi dan bai ,bing ju tong guo GO、KEGGzhu shi ,zhe xie de dao de cha yi dan bai jun biao xian chu yi ding cheng du de yu ben fen dai xie de xiang guan xing 。dan shi xiang jiao yu labelji shu de liang chong xiang dui ding liang fang fa ,tong guo iTRAQji shu de dao de cha yi dan bai zhong bao gua le ben fen qiang hua mei (Phenol hydroxylase)he L-bing an suan -DL-gu an suan cha xiang yi gou mei (L-alanine-DL-glutamate epimerase),er Label-freede liang chong fang fa bing mei you de dao 。ben fen qing hua mei (Phenol hydroxylase)he L-bing an suan -DL-gu an suan cha xiang yi gou mei (L-alanine-DL-glutamate epimerase)jun shi wei sheng wu dai xie ben fen yi ji ji ta fen lei hua ge wu zhong chong yao dan bai 。tong guo PCRkuo zeng jian ding le M-1zhong cun zai bian ma ben fen jing hua mei (Phenol hydroxylase)de ji yin 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自南京大学的陈桦，发表于刊物南京大学2019-07-02论文，是一篇关于酚类化合物降解论文,盐沼地区论文,蛋白质组学论文,南京大学2019-07-02论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自南京大学2019-07-02论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：酚类化合物降解论文; 盐沼地区论文; 蛋白质组学论文; 南京大学2019-07-02论文;