花生维生素E合成相关基因的克隆与鉴定

花生维生素E合成相关基因的克隆与鉴定

论文摘要

对于人类和动物来说,维生素E是一种重要的抗氧化物质。人体自身无法产生维生素E,主要从植物油获得,还可从其他植物产品中获得。维生素E可以消除氧自由基还能抵抗脂质的氧化,被认为具有减少患心血管疾病和癌症的几率的功能。在植物中,维生素E被认为与胁迫抗性和植物种子的寿命等相关。作为一种脂溶性的产物,维生素E存在于植株的很多部位如叶子、花和种子等,主要可以从植物油中获得。维生素E主要有生育酚和生育三烯酚两种形式,它们又各包含alfa、beta、gamma和sigma四种亚型。在四种亚型中,alfa型的活性最强;人体在吸收和分配的时候都比较偏好alfa型生育酚。到目前为止,已经从很多光合生物中克隆出了与维生素E生物合成的相关基因;通过转基因技术,这些基因被转入玉米、大豆和水稻等作物中,用于改善它们的品质。花生(Arachis hypogasa)是世界上一种重要的油料和蛋白作物,花生种子中的含油量高达50%。为了了解花生中维生素E的代谢机制并最终提高花生中维生素E的含量,我们通过RACE法克隆了一些参与维生素E合成的基因包括:生育酚环化酶基因(AhVTE1)、尿黑酸植基转移酶基因(AhVTE2-1和AhVTE2-2)和生育酚甲基转移酶基因(AhVTE4/Ah γ-TMT)。文章还分析了它们的结构特征,表达状况和进化演变。根据芯片和454测序的结果,用RACE法克隆出了花生维生素E生育酚环化酶基因,命名为AhVTE1, cDNA全长1622bp,含有一个1368bp的开放阅读框。也克隆了基因组DNA (gDNA),它含有9个内含子。通过多重序列比对发现,AhVTE1与大豆的VTE1的序列最接近;进化树构建表明AhVTE1可能来源于野生种A.ipaensis. RT-PCR结果显示,AhVTE1在花生种皮中的表达量最高,接着是根和叶子;结果还显示,在胚发育的过程中(20天,40天,60天),AhVTE1的表达量是逐渐增加的,在60天的时候有一个明显的上升。芯片结果分析显示,除了乙烯(ETH)引起AhVTE1下调表达22%外,AhVTE1对水杨酸(SA)、多效唑(PAC)、脱落酸(ABA)和茉莉酸甲酯(MeJ)四种激素处理的反应不明显。低温使AhVTE1的表达量下降,而干旱中则上调AhVTEl的表达量。通过RACE克隆了花生尿黑酸植基转移酶的两个基因(AHVTE2-1和AhVTE2-2两个基因)。AhVTE2-1 cDNA长1439bp, ORF为1170bp; AhVTE2-2 cDNA长1965bp,ORF为1218bp。多序列比对和物种进化树构建结果显示,AhVTE2-1与AhVTE2-2属于两个完全不同的分支;AhVTE2-1与其他物种的VTE2-1基因在进化树上的距离比较大,而AhVTE2-2则与大豆中的VTE2-2基因的相似度较高。进化树显示AhVTE2-2可能来源于野生种A. ipaensis。RT-PCR结果显示AhVTE2-1在根中的表达量最高,而AhVTE2-2在种皮中的表达量最高;两种基因在胚发育的过程中(20天、40天和60天)都表达量都逐渐的增加。芯片结果显示,两种基因在低温和干旱的条件下,表达量都下调了。AhVTE2-1在上述几种激素的处理下,表达量都上调了,SA是它的表达量上调了6倍;而AhVTE2-2的表达量这些激素的处理下在并没有变化太大。采用相似的方法获得了花生生育酚甲基转移酶基因(AhVTE4),其cDNA长度为1232bp, ORF为909bp。RT-PCR结果显示AhVTE4的表达量在种皮中最高,然后是果皮、叶子、花序、茎、根、果针和胚。在胚发育的过程中(20天、40天和60天),AhVTE4的表达量逐渐的下降。芯片结果显示,AhVTE4在PAC的处理下,表达量下降了39%;而SA、ABA和ETH对AhVTE4的表达量无影响。AhVTE4在干旱条件下表达量下降,而低温则未影响AhVTE4的表达量。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • Ⅰ 植物维生素E功能、生物合成以及分子调控研究
  • 1 引言
  • 2 植物维生素E对植物和动物的影响
  • 3 维生素E的结构类型、分布、代谢途径及其调控
  • 3.1 生育酚的结构类型和分布
  • 3.2 维生素E合成途径以及维生素E的调节
  • 4 维生素E合成基因
  • 5 花生维生素E改良进展
  • 6 结论与展望
  • 参考文献
  • Ⅱ 花生生育酚环化酶基因(AhVTE1)的克隆与鉴定
  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 材料
  • 2.2 RNA提取方法
  • 2.3 RACE法克隆基因
  • 2.4 AhVTE1的cDNA和gDNA全长扩增
  • 2.5 AhVTE1的生物信息学分析
  • 2.6 荧定量PCR分析
  • 2.7 芯片分析
  • 3 结果
  • 3.1 AhVTE1的克隆与分析
  • 3.2 AhVTE1物理-化学结构分析及功能域鉴定
  • 3.3 AhVTE1的多态性和进化
  • 3.4 AhVTE1时空表达分析
  • 3.5 不同处理下AhVTE1的表达状况
  • 4 讨论
  • 参考文献
  • Ⅲ 花生中尿黑酸植基基因(AhVTE2-1和AhVTE2-2)的克隆与鉴定
  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 材料
  • 2.2 总RNA提取
  • 2.3 RACE法克隆AhVTE2
  • 2.4 AhVTE2-1和AhVTE2-2的cDNA克隆
  • 2.5 AhVTE2-1和AhVTE2-2的生物信息学分析
  • 2.6 qRT-PCR分析
  • 2.7 芯片分析
  • 3 结果
  • 3.1 AhVTE2-1和AhVTE2-2的克隆与分析
  • 3.2 AhVTE2多态性分析和进化鉴定
  • 3.3 AhVTE2-1和AhVTE2-2时空表达分析
  • 3.4 AhVTE2-1和AhVTE2-2在不同处理胁迫下的表达量
  • 4 讨论
  • 参考文献
  • Ⅳ 花生gamma生育酚甲基转移酶基因(AhVTE4)的克隆与鉴定
  • 1 引言
  • 2 材料与方法
  • 2.1 材料
  • 2.2 总RNA提取
  • 2.3 RACE法克隆VTE4
  • 2.4 从cDNA克隆AhVTE4全长
  • 2.5 AhVTE4生物信息学分析
  • 2.6 qRT-PCR分析
  • 2.7 芯片数据分析
  • 3 结果
  • 3.1 AhVTE4的克隆与分析
  • 3.2 AhVTE4结构分析
  • 3.3 AhVTE4的时空表达分析
  • 3.4 AhVTE4在不同胁迫下的表达量
  • 4 讨论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 附录
  • 相关论文文献

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